RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

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Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 NRDCO43847 1150 aa13.79□□□□□ -0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 IFNA16P05015 189 aa13.79□□□□□ -0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 RNF4P78317 190 aa13.79□□□□□ -0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 PPP1R3AQ16821 1122 aa13.79□□□□□ -0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 OPN5Q6U736 354 aa13.79□□□□□ -0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 CLNKQ7Z7G1 428 aa13.79□□□□□ -0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 GALNT7Q86SF2 657 aa13.79□□□□□ -0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP13.79□□□□□ -0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 FAM222BQ8WU58 562 aa13.79□□□□□ -0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 SLCO2A1Q92959 643 aa13.79□□□□□ -0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 P04436 131 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa13.78□□□□□ -0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF321PQ8N8H1 164 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 OR14A16Q8NHC5 309 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 CSF3RQ99062 836 aa13.78□□□□□ -0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 SPRR3Q9UBC9 169 aa13.78□□□□□ -0.2
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ACTBP11-201ENST00000436287 ATG4BQ9Y4P1 393 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTBP11-201ENST00000436287 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 HSPB2A8KAH6 182 aa13.77□□□□□ -0.21
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ACTBP11-201ENST00000436287 GNAZP19086 355 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 PLA2G16P53816 162 aa13.77□□□□□ -0.21
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ACTBP11-201ENST00000436287 LIM2P55344 173 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 CDKL1Q00532 357 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 LTBQ06643 244 aa13.77□□□□□ -0.21
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ACTBP11-201ENST00000436287 SPANXN3Q5MJ09 141 aa13.77□□□□□ -0.21
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ACTBP11-201ENST00000436287 ANKRD7Q92527 254 aa13.77□□□□□ -0.21
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ACTBP11-201ENST00000436287 SH3GL2Q99962 352 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 EXO5Q9H790 373 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 NT5DC2Q9H857 520 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 DMRT3Q9NQL9 472 aa13.77□□□□□ -0.21
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ACTBP11-201ENST00000436287 CBLCQ9ULV8 474 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
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ACTBP11-201ENST00000436287 TNNI3P19429 210 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 HPDP32754 393 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 PIGAP37287 484 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 HNMTP50135 292 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 SERTAD2Q14140 314 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 CYP1B1Q16678 543 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 DEFB113Q30KQ7 82 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC22A10Q63ZE4 541 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM45BPQ6NSW5 357 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 ABHD17CQ6PCB6 329 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 ULK2Q8IYT8 1036 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 KRT78Q8N1N4 520 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 SPC24Q8NBT2 197 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
ACTBP11-201ENST00000436287 TRIM58Q8NG06 486 aa13.76□□□□□ -0.21
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