RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 APRTP07741 180 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR89BP0CG08 455 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 RALBP11234 206 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PVRP15151 417 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSNP26038 577 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD82P27701 267 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDHA2P29803 388 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 DLSTP36957 453 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSPAN7P41732 249 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRIA1P42261 906 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRLHRP49683 370 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 XIAPP98170 497 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC20Q12834 499 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHAF1BQ13112 559 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRKG2Q13237 762 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 FHL2Q14192 279 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSTD2Q5T7W7 516 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIRREL2Q6UWL6 708 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRGPRGQ86SM5 289 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM135Q86UB9 458 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRABD2AQ86V40 505 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 MOGAT3Q86VF5 341 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 OOSP2Q86WS3 158 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIANPQ8IYJ0 282 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFAP206Q8IYR0 622 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4N4Q8N0Y3 316 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 AVL9Q8NBF6 648 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF398Q8TD17 642 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRSK1Q8TDC3 778 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CT55Q8WUE5 264 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3KBP1Q96B97 665 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC45Q96CN5 670 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 HES6Q96HZ4 224 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF778Q96MU6 729 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALS2CR12Q96Q35 445 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 COPS8Q99627 209 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP3K3Q99759 626 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 MACROD1Q9BQ69 325 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM167BQ9BTA0 163 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 MECRQ9BV79 373 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSGA10Q9BZW7 698 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 XKR8Q9H6D3 395 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC40Q9H9A6 602 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 COG4Q9H9E3 785 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC40A1Q9NP59 571 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PILRAQ9UKJ1 303 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAM21Q9UKJ8 722 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS21Q9Y6M0 314 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 C5orf60A6NFR6 353 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 MGAT4DA6NG13 374 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 HMX3A6NHT5 357 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5K4A6NMS3 321 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 IQCF5A8MTL0 148 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM150CB9EJG8 249 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA8KD6RF30 607 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA8TH3BQL2 631 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 NKX2-8O15522 239 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT86O43790 486 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR1I1O60431 355 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOT2P00505 430 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPOP01588 193 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 FGGP02679 453 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 C9P02748 559 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC175P0C221 793 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD34CP0C6C1 535 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOLR1P15328 257 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDH3P22223 829 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 F8A1P23610 371 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXN2P32314 431 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 HADHAP40939 763 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRKAA2P54646 552 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARL4CP56559 192 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSDMDP57764 484 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRAMEP78395 509 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCZ1BP86790 482 aa4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDE1BQ01064 536 aa4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms