RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411257.1

RNU6-177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-177P-201ENST00000411257 MAGEA9P43362 315 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 CRKLP46109 303 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 CLDN17P56750 224 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 KRTAP12-4P60329 112 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 PRKCEQ02156 737 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 NUCB1Q02818 461 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 CACNG1Q06432 222 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 ACSM1Q08AH1 577 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 BECN1Q14457 450 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 RASA2Q15283 850 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 RBBP7Q16576 425 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 SGCBQ16585 318 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 PTGISQ16647 500 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF542PQ5EBM4 170 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 NHSL2Q5HYW2 709 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 C9orf152Q5JTZ5 239 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 KRBOX4Q5JUW0 171 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 C1orf141Q5JVX7 400 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 ERMARDQ5T6L9 678 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 AGBL2Q5U5Z8 902 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 GPR157Q5UAW9 335 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 OTPQ5XKR4 325 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 GPR139Q6DWJ6 353 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 NEPROQ6NW34 567 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 SLC30A6Q6NXT4 461 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 MZT2BQ6NZ67 158 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 COX8CQ7Z4L0 72 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 PRUNE1Q86TP1 453 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 TTC30BQ8N4P2 665 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 TC2NQ8N9U0 490 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 POGLUT1Q8NBL1 392 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF540Q8NDQ6 660 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF671Q8TAW3 534 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 LIPHQ8WWY8 451 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 SEPT1Q8WYJ6 367 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 PYCR2Q96C36 320 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 C16orf74Q96GX8 76 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 IMMP1LQ96LU5 166 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 MUS81Q96NY9 551 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 CASD1Q96PB1 797 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 PCDHB18PQ96TA0 734 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 KATNB1Q9BVA0 655 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 PINK1Q9BXM7 581 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 TEX12Q9BXU0 123 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 UBA5Q9GZZ9 404 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 MAF1Q9H063 256 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 SNX25Q9H3E2 840 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 WFDC1Q9HC57 220 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 ANKEF1Q9NU02 776 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 GIMAP4Q9NUV9 329 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 TMEM9Q9P0T7 183 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 WDR35Q9P2L0 1181 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 RNF24Q9Y225 148 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 NSG2Q9Y328 171 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-177P-201ENST00000411257 RLFQ13129 1914 aa0.59□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 PASKQ96RG2 1323 aa0.59□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 LRRK1Q38SD2 2015 aa0.59□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 A0A1W2PPW3 197 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF724A8MTY0 619 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 B4DXG7 233 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ANKRD63C9JTQ0 380 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAM86B1E9PN63 330 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 GPAA1O43292 621 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 EMC8O43402 210 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 APOA4P06727 396 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 FAM86B2P0C5J1 330 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 OR9G9P0C7N8 305 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 PSG2P11465 335 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ZNF44P15621 663 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 PDGFRAP16234 1089 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 LBPP18428 481 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 BDNFP23560 247 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 SSTR1P30872 391 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 PMELP40967 661 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 ID1P41134 155 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 CASP2P42575 452 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 RAD52P43351 418 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-177P-201ENST00000411257 KCNJ1P48048 391 aa0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms