RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384671.1

RNU6-959P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 959, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-959P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-959P-201ENST00000384671 CD59P13987 128 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 CNTFP26441 200 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 CXCL9Q07325 125 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 DHRS11Q6UWP2 260 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 AMIGO1Q86WK6 493 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 LAX1Q8IWV1 398 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 C6orf223Q8N319 242 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 ST8SIA4Q92187 359 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 SMARCD2Q92925 531 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 TTYH2Q9BSA4 534 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 SLC2A11Q9BYW1 496 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 RNF121Q9H920 327 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 MLXQ9UH92 298 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 SESN1Q9Y6P5 492 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 BAHCC1Q9P281 2608 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 LRRD1A4D1F6 860 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 ANHXE9PGG2 379 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 TOMM70O94826 608 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 YES1P07947 543 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 CYP11B1P15538 503 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 PDGFRAP16234 1089 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 PPP2R1BP30154 601 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 DUTP33316 252 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 CTRLP40313 264 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 LHX2P50458 406 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 ACTA1P68133 377 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 RALGDSQ12967 914 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 RAET1LQ5VY80 246 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 NCEH1Q6PIU2 408 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 MACC1Q6ZN28 852 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 AACSQ86V21 672 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZNF429Q86V71 674 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 CCDC26Q8TAB7 109 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 CCT6BQ92526 530 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 PCDHB18PQ96TA0 734 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 GLIPR2Q9H4G4 154 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 CLIC5Q9NZA1 410 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 STK26Q9P289 416 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 DPM3Q9P2X0 92 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 SCML2Q9UQR0 700 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 USP24Q9UPU5 2620 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 LRRC72A6NJI9 287 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 J3QRE1 110 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 MITFO75030 526 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 MBD4O95243 580 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 IGHV4-34P06331 123 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 CCDC159P0C7I6 412 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 GJA1P17302 382 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 GABRB1P18505 474 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 CTNNA2P26232 953 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 NRIP1P48552 1158 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 CCR6P51684 374 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 NUP107P57740 925 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 PRSS8Q16651 343 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 IQCCQ4KMZ1 466 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 DNLZQ5SXM8 178 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 SLC27A4Q6P1M0 643 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 SARM1Q6SZW1 724 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 OR10H4Q8NGA5 316 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 FRZBQ92765 325 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 ACTL8Q9H568 366 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 PLAGL1Q9UM63 463 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 MAST4O15021 2626 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 ACEP12821 1306 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 TRAV40A0A0B4J280 105 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 KIF5CO60282 957 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 MT-ND2P03891 347 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 POLBP06746 335 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 FCGR3AP08637 254 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 KRT3P12035 628 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 GOT1P17174 413 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 ARHGDIAP52565 204 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 CLDN15P56746 228 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 TIMM10P62072 90 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 ACTA2P62736 377 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 ACTC1P68032 377 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 CUL3Q13618 768 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 GRB14Q14449 540 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 IGFBP7Q16270 282 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 FAM83EQ2M2I3 478 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 ANKRD55Q3KP44 614 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 NEGR1Q7Z3B1 354 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 SUMF2Q8NBJ7 301 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 CLEC1AQ8NC01 280 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZBTB44Q8NCP5 570 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-959P-201ENST00000384671 IL17REQ8NFR9 667 aa-0.34□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms