RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372108.9

GTF3C5-204, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C5, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-204ENST00000372108 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.77□□□□□ -0.04
GTF3C5-204ENST00000372108 OOSP2Q86WS3 158 aa14.77□□□□□ -0.04
GTF3C5-204ENST00000372108 GKN2Q86XP6 184 aa14.77□□□□□ -0.04
GTF3C5-204ENST00000372108 EID3Q8N140 333 aa14.77□□□□□ -0.04
GTF3C5-204ENST00000372108 CBR4Q8N4T8 237 aa14.77□□□□□ -0.04
GTF3C5-204ENST00000372108 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
GTF3C5-204ENST00000372108 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.77□□□□□ -0.04
GTF3C5-204ENST00000372108 PYURFQ96I23 114 aa14.77□□□□□ -0.04
GTF3C5-204ENST00000372108 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.77□□□□□ -0.04
GTF3C5-204ENST00000372108 MAGIXQ9H6Y5 334 aa14.77□□□□□ -0.04
GTF3C5-204ENST00000372108 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.77□□□□□ -0.04
GTF3C5-204ENST00000372108 RAB26Q9ULW5 256 aa14.77□□□□□ -0.04
GTF3C5-204ENST00000372108 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.77□□□□□ -0.04
GTF3C5-204ENST00000372108 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 UPK1AO00322 258 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 TXNDC9O14530 226 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 PGRMC2O15173 223 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 DENRO43583 198 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 SH3BP5O60239 455 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 PRSS23O95084 383 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 HSPA13P48723 471 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 TGM3Q08188 693 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 MED21Q13503 144 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 SPRED1Q7Z699 444 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 RNF130Q86XS8 419 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 ARL14Q8N4G2 192 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 THAP11Q96EK4 314 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 GUCY1B2O75343 617 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 PCGF2P35227 344 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 FASLGP48023 281 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 HSPB3Q12988 150 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 C18orf63Q68DL7 685 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 GATA6Q92908 595 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 SMIM10Q96HG1 83 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 VPS50Q96JG6 964 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 BDH2Q9BUT1 245 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 NLNQ9BYT8 704 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 H0YGG7 62 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 VILLO15195 856 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 AQP9O43315 295 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 PROM1O43490 865 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 NOBOXO60393 691 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 KRT75O95678 551 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 ZNF682O95780 498 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 AIFM1O95831 613 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 CRYBA2P53672 197 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 VAC14Q08AM6 782 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 FADDQ13158 208 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 MLC1Q15049 377 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 RNF44Q7L0R7 432 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 NEUROD4Q9HD90 331 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 CD320Q9NPF0 282 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 ZNF639Q9UID6 485 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 POMT2Q9UKY4 750 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 B4GALT2O60909 372 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 SAXO2Q658L1 398 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 TSSK4Q6SA08 328 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 CAMKVQ8NCB2 501 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 NEURL3Q96EH8 262 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 AMDHD1Q96NU7 426 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 GLIPR2Q9H4G4 154 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 THEGQ9P2T0 379 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C5-204ENST00000372108 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms