RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366661.8

TTC13-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-201ENST00000366661 LGI4Q8N135 537 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 COQ10AQ96MF6 247 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 IFT22Q9H7X7 185 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 HPF1Q9NWY4 346 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SLC30A4O14863 429 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PI15O43692 258 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PIP5K1CO60331 668 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PAHP00439 452 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ESR1P03372 595 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CSF2RAP15509 400 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TYMPP19971 482 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 DNASE1P24855 282 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TACR1P25103 407 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 MAZP56270 477 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 DEFB103AP81534 67 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 FTMTQ8N4E7 242 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 OR8J3Q8NGG0 315 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 BRINP2Q9C0B6 783 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TNFRSF10BO14763 440 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 IFNA7P01567 189 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 RETP07949 1114 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 IRF1P10914 325 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 SCNN1AP37088 669 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 HK3P52790 923 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 MPPE1Q53F39 396 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 C12orf66Q96MD2 445 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 COPS8Q99627 209 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 GHITMQ9H3K2 345 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 EDARQ9UNE0 448 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 IRAK2O43187 625 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 ENGP17813 658 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 ITGB8P26012 769 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 HNMTP50135 292 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 PCDH1Q08174 1060 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 RNF130Q86XS8 419 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 HMGB4Q8WW32 186 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 HHATLQ9HCP6 504 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 COPZ2Q9P299 210 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 MTMR11A4FU01 709 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 TPST2O60704 377 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 ENTPD6O75354 484 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 MPC2O95563 127 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 LHCGRP22888 699 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 CNR2P34972 360 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 OR2G6Q5TZ20 316 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 AADATQ8N5Z0 425 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 DPP10Q8N608 796 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 OR52P1PQ8NH57 321 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 APOLD1Q96LR9 279 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 OPALINQ96PE5 141 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 SP110Q9HB58 689 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.7□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 M0R233 179 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 MUSKO15146 869 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 KERAO60938 352 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 CCNB2O95067 398 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 OAZ2O95190 189 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 F9P00740 461 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 HMGCLP35914 325 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 PUDPQ08623 228 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 SPHARQ15513 63 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 ZNF613Q6PF04 617 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 RANBP10Q6VN20 620 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 ZFP82Q8N141 532 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 OR2T35Q8NGX2 323 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 TSPEARQ8WU66 669 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 FCRL5Q96RD9 977 aa14.69□□□□□ -0.06
TTC13-201ENST00000366661 TMEM245Q9H330 911 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms