RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 NSFP46459 744 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC26A5P58743 744 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNJ10P78508 379 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SGCGQ13326 291 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 TAB1Q15750 504 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CARTPTQ16568 116 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 FGD3Q5JSP0 725 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 TCEAL6Q6IPX3 200 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 GALNT17Q6IS24 598 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ITIH5Q86UX2 942 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCNMB4Q86W47 210 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 HDDC3Q8N4P3 179 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 MARVELD2Q8N4S9 558 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR10G8Q8NGN5 311 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR2T6Q8NHC8 308 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 LIPHQ8WWY8 451 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM190Q8WZ59 177 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAB39BQ96DA2 213 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 COG3Q96JB2 828 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRR1Q96L50 414 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 DEFB118Q96PH6 123 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 OVOL2Q9BRP0 275 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 MTMR12Q9C0I1 747 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM245Q9H330 911 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 LIME1Q9H400 295 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLEKHA3Q9HB20 300 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC25A19Q9HC21 320 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 EXOC1Q9NV70 894 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATAD3AQ9NVI7 634 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 TCF19Q9Y242 345 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR5H15A6NDH6 313 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGAP42A6NI28 874 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 KPNA7A9QM74 516 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRSS44E7EML9 344 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 H3BMH7 237 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 K7EPI3 171 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SURF4O15260 269 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SYNGR4O95473 234 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 TXNDC12O95881 172 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CXCL10P02778 98 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 PGK2P07205 417 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SP1P08047 785 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 MMP10P09238 476 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 GNSP15586 552 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CD1DP15813 335 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 TNFRSF4P43489 277 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 GMFBP60983 142 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPL27P61353 136 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 IRX4P78413 519 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 DHODHQ02127 395 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPP2Q13103 211 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF528Q3MIS6 628 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC40Q4G0X9 1142 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 AGKQ53H12 422 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 C9orf50Q5SZB4 431 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 NKAIN2Q5VXU1 208 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLPP4Q5VZY2 271 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 UNC5DQ6UXZ4 953 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q6ZRG5 221 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 C18orf65Q6ZTR6 163 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 MCM10Q7L590 875 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 MIER3Q7Z3K6 550 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 TAF8Q7Z7C8 310 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CUZD1Q86UP6 607 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC22A15Q8IZD6 547 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 KDM8Q8N371 416 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC185Q8N715 623 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM99Q8N816 258 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CNBD1Q8NA66 436 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZBTB44Q8NCP5 570 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CNNM3Q8NE01 707 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR9Q2Q8NGE9 314 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF519Q8TB69 540 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAPK15Q8TD08 544 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNRF4Q8WWF5 429 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SELENOMQ8WWX9 145 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 MCHR2Q969V1 340 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM186Q96B77 213 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CFAP36Q96G28 342 aa2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms