RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLIC5Q9NZA1 410 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MLXQ9UH92 298 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC13A4Q9UKG4 626 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CACNG2Q9Y698 323 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1W2PPM1 405 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCNX2A6NKB5 2137 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 COLCA2A8K830 154 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM166BA8MTA8 275 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 B4DLN1 442 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM77I1YAP6 450 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTGESO14684 152 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBBP9O75884 186 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MMP23AO75900 390 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM63AO94886 807 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PYGLP06737 847 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 FCGR3AP08637 254 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC166P0CW27 439 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SAGP10523 405 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 LAMP2P13473 410 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDGFRAP16234 1089 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 GOT1P17174 413 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYP11B2P19099 503 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 XCR1P46094 333 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBASH3AP57075 661 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 IRF3Q14653 427 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF528Q3MIS6 628 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSPO2Q5TGU0 170 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 TCEAL6Q6IPX3 200 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 TTC27Q6P3X3 843 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC00336Q6ZUF6 198 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 IKBIPQ70UQ0 350 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 COX8CQ7Z4L0 72 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC01551Q86U37 167 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MFN1Q8IWA4 741 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARL14Q8N4G2 192 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR10S1Q8NGN2 331 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC22A8Q8TCC7 542 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD99L2Q8TCZ2 262 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RDH5Q92781 318 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MARC2Q969Z3 335 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PYCR2Q96C36 320 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC25A38Q96DW6 304 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC34Q96HJ3 373 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDHR1Q96JP9 859 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 COL21A1Q96P44 957 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 NRTNQ99748 197 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CPNE1Q99829 537 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITPAQ9BY32 194 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 EHD1Q9H4M9 534 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRGBPQ9NV56 204 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SAGE1Q9NXZ1 904 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSD3Q9NYI0 1048 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 TXNDC16Q9P2K2 825 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SORL1Q92673 2214 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRRK1Q38SD2 2015 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2A25A4D2G3 310 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR5H15A6NDH6 313 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMCO5BA8MYB1 307 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 J3QKU1 62 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPHP1O15259 732 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 MBD4O95243 580 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 TGDSO95455 350 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 FGF19O95750 216 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 RETP07949 1114 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARL14EPLP0DKL9 152 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSD17B1P14061 328 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP2R1BP30154 601 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ID1P41134 155 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSMD8P48556 350 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC26A2P50443 739 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF75DP51815 510 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGDIAP52565 204 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNTN1Q12860 1018 aa0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms