RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343131.6

SYCE1-202, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYCE1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-202ENST00000343131 DLG1Q12959 904 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 BMPR2Q13873 1038 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 RNF175Q8N4F7 328 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 PPM1NQ8N819 430 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 PSD4Q8NDX1 1056 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 KIAA1191Q96A73 305 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 LURAP1Q96LR2 239 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 KCNC2Q96PR1 638 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 MS4A8Q9BY19 250 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 OR8D2Q9GZM6 311 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.73□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 FAM187AA6NFU0 413 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 FAM166BA8MTA8 275 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 A8MVJ9 347 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 E9PLN8 166 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 UBXN8O00124 270 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 ZFAND5O76080 213 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 PDE9AO76083 593 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 TUBB4AP04350 444 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 PCNAP12004 261 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 PTGS2P35354 604 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 KIR3DL1P43629 444 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 TRADDQ15628 312 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 CDKL4Q5MAI5 379 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 IL20RBQ6UXL0 311 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 RAPH1Q70E73 1250 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 OR52N2Q8NGI0 321 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 FAM57AQ8TBR7 257 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 ASB15Q8WXK1 588 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 RASL10BQ96S79 203 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 VKORC1Q9BQB6 163 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 CD244Q9BZW8 370 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 HPF1Q9NWY4 346 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 NUDT4Q9NZJ9 180 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 RNF14Q9UBS8 474 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.72□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 F8P00451 2351 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 C17orf105B2RV13 164 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 SSR2P43308 183 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 HK2P52789 917 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 PLTPP55058 493 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 IRF9Q00978 393 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 TGM3Q08188 693 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 STX4Q12846 297 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 HSDL2Q6YN16 418 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 OR2M7Q8NG81 312 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 IGSF5Q9NSI5 407 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 MYOTQ9UBF9 498 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 HRH3Q9Y5N1 445 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 LIPGQ9Y5X9 500 aa14.71□□□□□ -0.05
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CTNSO60931 367 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 KERAO60938 352 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 TGFB1P01137 390 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 LAPTM5Q13571 262 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 RCN2Q14257 317 aa14.7□□□□□ -0.06
SYCE1-202ENST00000343131 TBCCQ15814 346 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.1 ms