RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 TM7SF3Q9NS93 570 aa15.62■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 GPR83Q9NYM4 423 aa15.62■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa15.62■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 BMP4P12644 408 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ADRB3P13945 408 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 FCHO2Q0JRZ9 810 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CAMK1Q14012 370 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OXA1LQ15070 435 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 MICAQ29983 383 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ADCK1Q86TW2 530 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SPERTQ8NA61 448 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 GGHQ92820 318 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ITM2CQ9NQX7 267 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF226Q9NYT6 803 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 C5AR2Q9P296 337 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SLC23A2Q9UGH3 650 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 M0R082 166 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ITGB7P26010 798 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 BMPR1AP36894 532 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 DUSP7Q16829 419 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 DGUOKQ16854 277 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM40Q6P9F5 258 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 TMC5Q6UXY8 1006 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CACUL1Q86Y37 369 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 RHOXF1Q8NHV9 184 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 VMP1Q96GC9 406 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 FAM129BQ96TA1 746 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CXorf36Q9H7Y0 433 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 HMG20AQ9NP66 347 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SLAMF7Q9NQ25 335 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 MIEF1Q9NQG6 463 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ACER3Q9NUN7 267 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 FAM227AF5H4B4 570 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 RECKO95980 971 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJC22Q8N4W6 341 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OXR1Q8N573 874 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OR52A5Q9H2C5 316 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM38AQ9H6F2 299 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 IL23AQ9NPF7 189 aa15.61■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 KIAA0355O15063 1070 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ICMTO60725 284 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 LRRC74AQ0VAA2 488 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 UBE2UQ5VVX9 321 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 MFSD4AQ8N468 514 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OR2L2Q8NH16 312 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 F2RL3Q96RI0 385 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 EFCAB9A8MZ26 197 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PLPP1O14494 284 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 STSP08842 583 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PSMB5P28074 263 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CRISP3P54108 245 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 FADDQ13158 208 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PAGE2Q7Z2X7 111 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SLC9B2Q86UD5 537 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 DEPDC4Q8N2C3 294 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 OR8D1Q8WZ84 308 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 BCL7BQ9BQE9 202 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ITPAQ9BY32 194 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 C11orf49Q9H6J7 331 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 TAC3Q9UHF0 121 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa15.6■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 TRPM6Q9BX84 2022 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 TRBC2A0A5B9 178 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 FEZF1A0PJY2 475 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 TMCC2O75069 709 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CRYZL1O95825 349 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 PIK3CBP42338 1070 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 XCR1P46094 333 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 ALDH9A1P49189 494 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 RBBP4Q09028 425 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 CRB2Q5IJ48 1285 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 FAM129CQ86XR2 697 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 LGR4Q9BXB1 951 aa15.59■□□□□ 0.09
SHQ1-201ENST00000325599 THSD1Q9NS62 852 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms