RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 EVA1BQ9NVM1 165 aa21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0J9YVX5 310 aa21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 OR5K4A6NMS3 321 aa21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF10O60809 474 aa21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 DDX5P17844 614 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 LSSP48449 732 aa21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 BLKP51451 505 aa21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 SCARB2Q14108 478 aa21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 SLC36A3Q495N2 470 aa21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 FIGLAQ6QHK4 219 aa21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 CYGBQ8WWM9 190 aa21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 OR2A5Q96R48 311 aa21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM38AQ9H6F2 299 aa21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 HRASLS2Q9NWW9 162 aa21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 TAS2R7Q9NYW3 318 aa21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 U3KQV3 271 aa21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
VSTM4-201ENST00000298454 hCG_2039718K7EN88 272 aa21.58■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 PGRMC2O15173 223 aa21.58■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 PVRP15151 417 aa21.58■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 CD27P26842 260 aa21.58■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ALDH3A2P51648 485 aa21.58■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 RPS26P62854 115 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 BTN3A2P78410 334 aa21.58■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 VLDLRP98155 873 aa21.58■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 DAG1Q14118 895 aa21.58■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 C18orf63Q68DL7 685 aa21.58■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa21.58■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 NEUROD4Q9HD90 331 aa21.58■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 VNN3Q9NY84 501 aa21.58■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 PDP2Q9P2J9 529 aa21.58■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM229AB2RXF0 380 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 B4GALT2O60909 372 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ALPLP05186 524 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ARFIP1P53367 373 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 CYBRD1Q53TN4 286 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SAXO2Q658L1 398 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SPESP1Q6UW49 350 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 GLIPR2Q9H4G4 154 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SMURF2Q9HAU4 748 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 EHD3Q9NZN3 535 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 PADI4Q9UM07 663 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 C2orf74A8MZ97 194 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 B4DGG1 531 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 P2RX6O15547 441 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 DIRAS1O95057 198 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 AIFM1O95831 613 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 CLIC3O95833 236 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 OPN1SWP03999 348 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1CAP62136 330 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 HHEXQ03014 270 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 RBBP4Q09028 425 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD34AQ69YU3 496 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 NT5CQ8TCD5 201 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SDCCAG3Q96C92 435 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 NEURL3Q96EH8 262 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 FBXL20Q96IG2 436 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 RAD21L1Q9H4I0 556 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 PRDM6Q9NQX0 595 aa21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PR77 199 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 STK25O00506 426 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 FABP3P05413 133 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 CD38P28907 300 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 DCTP40126 519 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 TSFMP43897 325 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 RGS19P49795 217 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 CDK6Q00534 326 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 RGS1Q08116 209 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SPDYE7PQ495Y7 208 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 FRMPD2BQ6IN97 320 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 KRT80Q6KB66 452 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 FAM174AQ8TBP5 190 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 GAL3ST3Q96A11 431 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 TM4SF19Q96DZ7 209 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 NELL2Q99435 816 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ADPRHL2Q9NX46 363 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 PILRAQ9UKJ1 303 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa21.56■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1B0GTW7 788 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 FAM221BA6H8Z2 402 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 VGLL3A8MV65 326 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SUV39H1O43463 412 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 SH3BP5O60239 455 aa21.55■■□□□ 1.04
VSTM4-201ENST00000298454 E2F6O75461 281 aa21.55■■□□□ 1.04
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