RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271628.8

SF3B4-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4-201ENST00000271628 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 A0A0G2JNG1 304 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 A0A0J9YVX5 310 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 FAM221BA6H8Z2 402 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ZW10O43264 779 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 FRKP42685 505 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 MVDP53602 400 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TGM3Q08188 693 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 HYAL2Q12891 473 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 KIR2DS5Q14953 304 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 RAB39AQ14964 217 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TBPL2Q6SJ96 375 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PAQR7Q86WK9 346 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 KLHDC7BQ96G42 594 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 NELL2Q99435 816 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 IL1RAPQ9NPH3 570 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TRIOO75962 3097 aa14.55□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TRIM64BA6NI03 449 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TNFRSF21O75509 655 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ALPLP05186 524 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 CTSEP14091 401 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PRIM2P49643 509 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 EPS8Q12929 822 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 MLC1Q15049 377 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PRSS53Q2L4Q9 553 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TJAP1Q5JTD0 557 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TBC1D20Q96BZ9 403 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 BAG5Q9UL15 447 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TNFSF14O43557 240 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 FKBP9O95302 570 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 CPNE6O95741 557 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 THRBP10828 461 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 SOAT1P35610 550 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 GPR18Q14330 331 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 GAS6Q14393 721 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 UBXN2BQ14CS0 331 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TTC23Q5W5X9 447 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ZNF773Q6PK81 442 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 MMP21Q8N119 569 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PPP1R14BQ96C90 147 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 KLHL31Q9H511 634 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 CPNE7Q9UBL6 633 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 WNT16Q9UBV4 365 aa14.54□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 H3BMQ9 156 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PFDN1O60925 122 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 FABP3P05413 133 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 NUDT7P0C024 238 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ETFAP13804 333 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 RXRGP48443 463 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ARHGDIAP52565 204 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 STARD6P59095 220 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 SLAMF1Q13291 335 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 SPIDRQ14159 915 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 FZD2Q14332 565 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 C16orf72Q14CZ0 275 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 STK32CQ86UX6 486 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PARGQ86W56 976 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 COG8Q96MW5 612 aa14.53□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 MUS81Q96NY9 551 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms