RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218348.7

USP11-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP11, Length 3,338 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-201ENST00000218348 RNF130Q86XS8 419 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PTOV1Q86YD1 416 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 EID3Q8N140 333 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SLC44A3Q8N4M1 653 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ATG16L2Q8NAA4 619 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 HM13Q8TCT9 377 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TESCQ96BS2 214 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 FCRL4Q96PJ5 515 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SLC35A5Q9BS91 424 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 RHNO1Q9BSD3 238 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 HAUS8Q9BT25 410 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 MUC13Q9H3R2 512 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 GORASP2Q9H8Y8 452 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 AMBNQ9NP70 447 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 GIMAP4Q9NUV9 329 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 LINC01387J3KSC0 135 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 NARSO43776 548 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SEMA3DO95025 777 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 MYF6P23409 242 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 FMO3P31513 532 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 HPCAL1P37235 193 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PMS2P3Q13401 168 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 APOFQ13790 326 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ZZZ3Q8IYH5 903 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 NFKBIDQ8NI38 313 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ITPKCQ96DU7 683 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 YIPF4Q9BSR8 244 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SERHL2Q9H4I8 314 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 RAB23Q9ULC3 237 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 POM121BA6NF01 834 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 M0R129 80 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 AP1G1O43747 822 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ACADLP28330 430 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 GZMMP51124 257 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 IFITM2Q01629 132 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ADRM1Q16186 407 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 MPEG1Q2M385 716 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 LRIF1Q5T3J3 769 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TMEM26Q6ZUK4 368 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CROCCP3Q8IVE0 287 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CHTF18Q8WVB6 975 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 C17orf62Q9BQA9 187 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ANKRA2Q9H9E1 313 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 WDR70Q9NW82 654 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 KIF17Q9P2E2 1029 aa9.51□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 C8orf89P0DMQ9 161 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ICAM2P13598 275 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ZNF763Q0D2J5 394 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SLC5A12Q1EHB4 618 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ZNF750Q32MQ0 723 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PAGE2BQ5JRK9 111 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 FAM46CQ5VWP2 391 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 GLRX5Q86SX6 157 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SLC51BQ86UW2 128 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TMEM145Q8NBT3 493 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 GHITMQ9H3K2 345 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 FAM118AQ9NWS6 357 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 FAM220BPB1ANY3 271 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 J3KTA2 159 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PRKCAP17252 672 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TPTEP56180 551 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ESRRGP62508 458 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PPP2CBP62714 309 aa9.5□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PPP2CAP67775 309 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms