RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031327.8

Cxcl1-201, Transcript of Growth-regulated alpha protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cxcl1, Length 953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Pmf1Q9CPV5 202 aa10□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Txndc9Q9CQ79 226 aa10□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Mcm8Q9CWV1 833 aa10□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 CsQ9CZU6 464 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Ccdc130Q9D516 385 aa10□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 TrilQ9DBY4 809 aa10□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 GhrlQ9EQX0 117 aa10□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Slc30a7Q9JKN1 378 aa10□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Cyp2d22Q9JKY7 500 aa10□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Dbf4Q9QZ41 663 aa10□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Chd9Q8BYH8 2885 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Rps2-ps6A0A140T8L5 221 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Igkv9-123A0A140T8N8 117 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Slc25a25A2ASZ8 469 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Nipsnap3aB1AWZ3 247 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Cped1B2RX70 1026 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Olfr620E9PZ66 313 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Gm8159E9Q0R1 267 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Zfp619G3X9T2 1161 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Ephb6O08644 1014 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Il2raP01590 268 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Zfp60P16374 707 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Ptgs1P22437 602 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Ido1P28776 407 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Chrm4P32211 479 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Cdh5P55284 784 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Cyb5r2Q3KNK3 276 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Tmem248Q3TBN1 314 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 HgsnatQ3UDW8 656 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 CamkvQ3UHL1 512 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Pcgf5Q3UK78 256 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Scn2bQ56A07 215 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Glp2rQ5IXF8 512 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Tle4Q62441 773 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Trim24Q64127 1051 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Htr1aQ64264 421 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 BC061237Q6P8I2 184 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Zfp748Q7TPL6 888 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Ckap2lQ7TS74 745 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Lpar4Q8BLG2 370 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Pgm2l1Q8CAA7 621 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Piwil4Q8CGT6 848 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Dleu7Q8CHZ8 209 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Noxo1Q8VCM2 349 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Olfr1311Q8VET0 312 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Olfr1276Q8VF40 312 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Olfr514Q8VFZ6 310 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Olfr763Q8VGC1 309 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Rbms1Q91W59 403 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Siglec5Q920G3 569 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Cela3bQ9CQ52 269 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 3100002H09RikQ9CXW6 140 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Commd8Q9CZG3 183 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Exosc7Q9D0M0 291 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Asb5Q9D1A4 329 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 1700013H16RikQ9DAC5 291 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Slc25a18Q9DB41 320 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Pop7Q9DCH2 140 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Galnt16Q9JJ61 558 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Tgm1Q9JLF6 815 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Crim1Q9JLL0 1037 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Crlf3Q9Z2L7 442 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 9930021J03RikH3BKP8 2027 aa9.99□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Vmn1r90A0A087WR36 309 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Cfap77A0A087WRI3 283 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Gm13040A2A8C4 496 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Gm7849D3YX03 116 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Mroh5E9PUJ8 762 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 EmdO08579 259 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Trove2O08848 538 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Hs3st1O35310 311 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Tgm2P21981 686 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 CartptP56388 129 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 AgrpP56473 131 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Drd2P61168 444 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Ext1P97464 746 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Serpina6Q06770 397 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Aars2Q14CH7 980 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Mmp25Q3U435 615 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Pnpla1Q3V1D5 599 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Dhrs9Q58NB6 319 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 TsnQ62348 228 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 OmpQ64288 163 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Galnt2Q6PB93 570 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Olfr1051Q7TR76 308 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 ItpkcQ7TS72 678 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Hapln4Q80WM4 400 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Ccdc116Q80X53 541 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 P4htmQ8BG58 503 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Serinc5Q8BHJ6 461 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Dusp28Q8BTR5 163 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Prdm8Q8BZ97 687 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Aph1bQ8C7N7 257 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Atxn7l2Q8C8K6 696 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 C1sbQ8CFG8 688 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 C1rbQ8CFG9 706 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Mib2Q8R516 973 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Olfr350Q8VFP8 312 aa9.98□□□□□ -0.81
Cxcl1-201ENSMUST00000031327 Olfr1390Q8VGW9 311 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 60.1 ms