RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	LGALS12	Q96DT0	336 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TRBC2	A0A5B9	178 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	STATH	P02808	62 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	FUCA1	P04066	466 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	POU1F1	P28069	291 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	GGT2	P36268	569 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	P2RY2	P41231	377 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	GJA8	P48165	433 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	MAPK12	P53778	367 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	FADD	Q13158	208 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CYP2A13	Q16696	494 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	C17orf64	Q86WR6	236 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TMIE	Q8NEW7	156 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	OR2A25	A4D2G3	310 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	BCHE	P06276	602 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PIK3CB	P42338	1070 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	IL12RB1	P42701	662 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	DGUOK	Q16854	277 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ADCK2	Q7Z695	626 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	FAM129C	Q86XR2	697 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	KRT78	Q8N1N4	520 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	NLN	Q9BYT8	704 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	HMG20A	Q9NP66	347 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	GPR34	Q9UPC5	381 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	LINC01553	A4QN01	128 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	IGLON5	A6NGN9	336 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PCDH8	O95206	1070 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	GADD45G	O95257	159 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	DSTN	P60981	165 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	DPT	Q07507	201 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	RBBP4	Q09028	425 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PDZD3	Q86UT5	571 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SUSD6	Q92537	303 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	GGH	Q92820	318 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	UCN3	Q969E3	161 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ACER3	Q9NUN7	267 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	OR1A2	Q9Y585	309 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PRR23A	A6NEV1	266 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PPM1D	O15297	605 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	DPM1	O60762	260 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	KRT75	O95678	551 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	STS	P08842	583 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ANXA8	P13928	327 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	KEL	P23276	732 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PTGER1	P34995	402 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CTSK	P43235	329 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	CBX3	Q13185	183 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	GAB4	Q2WGN9	574 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF605	Q86T29	641 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TAGAP	Q8N103	731 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2E3	Q969T4	207 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	EYS	Q5T1H1	3165 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM247	A6NEH6	219 aa		12.48	□□□□□ -0.41

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