RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	XCR1	P46094	333 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	CUL2	Q13617	745 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	HERPUD1	Q15011	391 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	TAF3	Q5VWG9	929 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF544	Q6NX49	715 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM270	Q6UE05	265 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PDILT	Q8N807	584 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	TSLP	Q969D9	159 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	S100PBP	Q96BU1	408 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	RADIL	Q96JH8	1075 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PSKH2	Q96QS6	385 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	DRC3	Q9H069	523 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM72C	H0Y354	149 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	CTDNEP1	O95476	244 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	CALCA	P01258	141 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	ANPEP	P15144	967 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	GCK	P35557	465 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	KHK	P50053	298 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	COMTD1	Q86VU5	262 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC25	Q86WR0	208 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM72B	Q86X60	149 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	DPF1	Q92782	380 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SEMA4D	Q92854	862 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	ULK4	Q96C45	1275 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC77	Q9BR77	488 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1B0GW55	424 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	C1orf226	A1L170	272 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL33	A6NCF5	533 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PIP5K1B	O14986	540 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SHOX	O15266	292 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	FOXS1	O43638	330 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	ACSL3	O95573	720 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC4A1	P02730	911 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	DAO	P14920	347 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	CPN1	P15169	458 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMA5	P28066	241 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	AVPR1B	P47901	424 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	NUCB1	Q02818	461 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP3CA	Q08209	521 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PDCL	Q13371	301 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	P2RY6	Q15077	328 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	TAB1	Q15750	504 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SNAP23-223	ENST00000627440	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		5.49	□□□□□ -1.53

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