RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TIFABQ6ZNK6 161 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 BEST3Q8N1M1 668 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TEX19Q8NA77 164 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 C3orf49Q96BT1 292 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GJD2Q9UKL4 321 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PMM2O15305 246 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CLRN1P58418 232 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OGDHQ02218 1023 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 BMFQ96LC9 184 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD28O15084 1053 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 L1CAMP32004 1257 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 BLOC1S1P78537 153 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 M1APQ8TC57 530 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ACTL8Q9H568 366 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF225Q9UK10 706 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 LAMB4A4D0S4 1761 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 INPPL1O15357 1258 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 BEST1O76090 585 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HDCP19113 662 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GPR143P51810 404 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CDH15P55291 814 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF75AQ96N20 296 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MAGEH1Q9H213 219 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FNIP2Q9P278 1114 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 INSIG1O15503 277 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OXTRP30559 389 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GRM5P41594 1212 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 IL10RBQ08334 325 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MADCAM1Q13477 382 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 UPP1Q16831 310 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RGMAQ96B86 450 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PLD4Q96BZ4 506 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 APMAPQ9HDC9 416 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ABCC6O95255 1503 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KNTC1P50748 2209 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 A0A087WUU8 490 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 K7EPI3 171 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 AHCYP23526 432 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MAGEA11P43364 429 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MAP2K3P46734 347 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HMGCS1Q01581 520 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PARGQ86W56 976 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTPRT-209ENST00000612229 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 NT5EP21589 574 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ADORA2AP29274 412 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ENTPD1P49961 510 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FOXK1P85037 733 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FAM182BQ5T319 152 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 EBF4Q9BQW3 602 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 BRF2Q9HAW0 419 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 LUZP4Q9P127 313 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SBK2P0C263 348 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 BMP4P12644 408 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PTPRAP18433 802 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
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