RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM166BA8MTA8 275 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ANHXE9PGG2 379 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 AP3D1O14617 1153 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 DEDDO75618 318 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 DDX58O95786 925 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 PNPP00491 289 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRB1P04280 392 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CSN3P07498 182 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 RETP07949 1114 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SBK2P0C263 348 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR9G9P0C7N8 305 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 P4HA1P13674 534 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CD22P20273 847 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 MNAT1P51948 309 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 RBBP4Q09028 425 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 RALGDSQ12967 914 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CUL3Q13618 768 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 GRB14Q14449 540 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 RPS6KA1Q15418 735 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 NPTX1Q15818 432 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 TAF12Q16514 161 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 QRICH1Q2TAL8 776 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 NEPROQ6NW34 567 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 Q71RC1 249 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ARRDC1Q8N5I2 433 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 MDS2Q8NDY4 140 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF671Q8TAW3 534 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CD99L2Q8TCZ2 262 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 LIPHQ8WWY8 451 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 MARC2Q969Z3 335 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZUFSPQ96AP4 578 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CDRT15Q96T59 188 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 OSBPL11Q9BXB4 747 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRRG4Q9BZD6 226 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 PDCL3Q9H2J4 239 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 MMP27Q9H306 513 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 NT5DC2Q9H857 520 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 NMUR1Q9HB89 426 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 C3orf14Q9HBI5 128 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SH3GLB2Q9NR46 395 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ABCC13Q9NSE7 274 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 MLXQ9UH92 298 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 OPN4Q9UHM6 478 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 DGKBQ9Y6T7 804 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SHANK1Q9Y566 2161 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SHROOM3Q8TF72 1996 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF407Q9C0G0 2248 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 MYO1GB0I1T2 1018 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 C17orf105B2RV13 164 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 PTGESO14684 152 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 KIF5CO60282 957 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 TGDSO95455 350 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CD4P01730 458 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 MT-ND2P03891 347 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SERPING1P05155 500 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 RB1P06400 928 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAB40ALP0C0E4 278 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SAGP10523 405 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 EPCAMP16422 314 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 GJA1P17302 382 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 IL2RGP31785 369 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ACVR1BP36896 505 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRAPPC10P48553 1259 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 LHX1P48742 406 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CDH8P55286 799 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLAQ13239 276 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 TAF9Q16594 264 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 MICAQ29983 383 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CNPY1Q3B7I2 92 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 ANKRD55Q3KP44 614 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 C5orf47Q569G3 176 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 PAGE2BQ5JRK9 111 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 TATDN1Q6P1N9 297 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CHST9Q7L1S5 443 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 CLEC1AQ8NC01 280 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 SEPT1Q8WYJ6 367 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-90P-201ENST00000606352 MYDGFQ969H8 173 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms