RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MACROD1Q9BQ69 325 aa11.25□□□□□ -0.61
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRT78Q8N1N4 520 aa11.24□□□□□ -0.61
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TM4SF18Q96CE8 201 aa11.24□□□□□ -0.61
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WFDC6Q9BQY6 131 aa11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GABARAPL3Q9BY60 117 aa11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM38AQ9H6F2 299 aa11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCHEP06276 602 aa11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CA3P07451 260 aa11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD36P16671 472 aa11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LIPAP38571 399 aa11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FADDQ13158 208 aa11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCTLQ6UWM7 567 aa11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DCDC5Q6ZRR9 648 aa11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SZRD1Q7Z422 152 aa11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC01555Q8NAE3 123 aa11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC38A5Q8WUX1 472 aa11.24□□□□□ -0.61
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