RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589916.5

BCAS3-223, Transcript of BCAS3, microtubule associated cell migration factor, human

TSL 2

Gene BCAS3, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BCAS3-223	ENST00000589916	MANBA	O00462	879 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	BTN3A3	O00478	584 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	OR7A17	O14581	309 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	FFAR3	O14843	346 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	GPR42	O15529	346 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	ITM2A	O43736	263 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	SNX3	O60493	162 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	CCDC22	O60826	627 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	RASSF9	O75901	435 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	OR4F21	O95013	312 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	C9	P02748	559 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	CHRNG	P07510	517 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	PCNA	P12004	261 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	CDH1	P12830	882 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	UGT2B7	P16662	529 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	NPPB	P16860	134 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	ZNF28	P17035	718 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	TSPAN8	P19075	237 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	DRD4	P21917	467 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	AHR	P35869	848 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	PIK3CB	P42338	1070 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	KIR3DL1	P43629	444 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	IST1	P53990	364 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	SEC24C	P53992	1094 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	AQP5	P55064	265 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	STX1B	P61266	288 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	SH3BP2	P78314	561 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	REEP5	Q00765	189 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	RELA	Q04206	551 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	RGS1	Q08116	209 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	DOC2A	Q14183	400 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	PCOLCE	Q15113	449 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	RPS6KA2	Q15349	733 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	SMU1	Q2TAY7	513 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	CPZ	Q66K79	652 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	CHSY3	Q70JA7	882 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	KMT5C	Q86Y97	462 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	TRPV3	Q8NET8	790 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	OR2L3	Q8NG85	312 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	PATE1	Q8WXA2	126 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	NCSTN	Q92542	709 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	NEIL2	Q969S2	332 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	CCDC120	Q96HB5	630 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	QRFPR	Q96P65	431 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	SERPINI1	Q99574	410 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	CTRC	Q99895	268 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	DPH7	Q9BTV6	452 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	MENT	Q9BUN1	341 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	NUF2	Q9BZD4	464 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	RAB33B	Q9H082	229 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	BRF2	Q9HAW0	419 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	FANCE	Q9HB96	536 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	PNPO	Q9NVS9	261 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	POMT2	Q9UKY4	750 aa		5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
BCAS3-223	ENST00000589916	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		5.24	□□□□□ -1.57

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