RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	KCNK13	Q9HB14	408 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	PLAA	Q9Y263	795 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	SPACA6	W5XKT8	324 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469		A0A1W2PPM1	405 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	DYTN	A2CJ06	578 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CYR61	O00622	381 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	GLRA3	O75311	464 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	OTC	P00480	354 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	HERVK_113	P63132	956 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ARG2	P78540	354 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	TRAF3	Q13114	568 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	SLC13A2	Q13183	592 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	RASA2	Q15283	850 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CUZD1	Q86UP6	607 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ATCAY	Q86WG3	371 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	MAP10	Q9P2G4	905 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469		A8MUI8	341 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	DLX3	O60479	287 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CDH16	O75309	829 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ARFIP1	P53367	373 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CDH13	P55290	713 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF33B	Q06732	778 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CUL3	Q13618	768 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	TLR1	Q15399	786 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	FRG2	Q64ET8	278 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	WDR93	Q6P2C0	686 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	FRG2B	Q96QU4	278 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CLMP	Q9H6B4	373 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	PPT2	Q9UMR5	302 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469		A8MUA0	341 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	PLPP1	O14494	284 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	SUPT7L	O94864	414 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	NEK2	P51955	445 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	TAS2R50	P59544	299 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	IFT88	Q13099	833 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	EMB	Q6PCB8	327 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	SLC5A8	Q8N695	610 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	HAS2	Q92819	552 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	TMEM237	Q96Q45	408 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	SERPINI1	Q99574	410 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	RNF32	Q9H0A6	362 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	STMN3	Q9NZ72	180 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		18.79	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	BLACE	A4D250	179 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CTNS	O60931	367 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	NUDT17	P0C025	328 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	TSPAN8	P19075	237 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CPN2	P22792	545 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	PRKAA2	P54646	552 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CLC	Q05315	142 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	SLAMF1	Q13291	335 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	TERF2	Q15554	542 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	UNC50	Q53HI1	259 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ACER2	Q5QJU3	275 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ELP5	Q8TE02	316 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6

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