RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-205	ENST00000577827	NR4A2	P43354	598 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	ADAM8	P78325	824 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	RPA4	Q13156	261 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	GTDC1	Q4AE62	458 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	RAB41	Q5JT25	222 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	PHC2	Q8IXK0	858 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	NT5C3B	Q969T7	300 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	SNX18	Q96RF0	628 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	USP3	Q9Y6I4	520 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	APOL3	O95236	402 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	RGS6	P49758	472 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	CAP1	Q01518	475 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	KIF18B	Q86Y91	864 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	TESC	Q96BS2	214 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	TBX5	Q99593	518 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	UGT2B10	P36537	528 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	GRK6	P43250	576 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	BDKRB1	P46663	353 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	TSPAN5	P62079	268 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	IRF5	Q13568	498 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	CACUL1	Q86Y37	369 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	CADM2	Q8N3J6	435 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	CLMP	Q9H6B4	373 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	NDUFB5	O43674	189 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	MTX2	O75431	263 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	CPNE6	O95741	557 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	DGKE	P52429	567 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	SELPLG	Q14242	412 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	PTPN18	Q99952	460 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	BEX2	Q9BXY8	128 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	OR51I1	Q9H343	314 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	LATS1	O95835	1130 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	FUCA1	P04066	466 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	BMP4	P12644	408 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	BMP8B	P34820	402 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	CNR2	P34972	360 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	DOC2A	Q14183	400 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	CBLL1	Q75N03	491 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	RNF31	Q96EP0	1072 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	LRR1	Q96L50	414 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	MYOC	Q99972	504 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PTPRM-205	ENST00000577827		A0A1W2PRQ8	180 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PTPRM-205	ENST00000577827	PPP6C	O00743	305 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PTPRM-205	ENST00000577827	PROM1	O43490	865 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PTPRM-205	ENST00000577827	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	9.96	□□□□□ -0.82
PTPRM-205	ENST00000577827	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
PTPRM-205	ENST00000577827	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
PTPRM-205	ENST00000577827	SEMG2	Q02383	582 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PTPRM-205	ENST00000577827	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
PTPRM-205	ENST00000577827	SLC3A1	Q07837	685 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PTPRM-205	ENST00000577827	ZNF234	Q14588	700 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PTPRM-205	ENST00000577827	RGN	Q15493	299 aa		9.96	□□□□□ -0.82

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms