RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566458.5

RNPS1-220, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RNPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-220ENST00000566458 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 NLNQ9BYT8 704 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 PRDM8Q9NQV8 689 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 BLOC1S6Q9UL45 172 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 LRIT2A6NDA9 550 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 E9PQ18 207 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 SLC31A1O15431 190 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 PDPK1O15530 556 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 DDX5P17844 614 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 DCKP27707 260 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 SOAT1P35610 550 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 CLK3P49761 638 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 PPP2CBP62714 309 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 PPP2CAP67775 309 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 CDK5R2Q13319 367 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 KRT33BQ14525 404 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 RPE65Q16518 533 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 SAXO2Q658L1 398 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 XAF1Q6GPH4 301 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 OR4C11Q6IEV9 310 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 FAM180BQ6P0A1 224 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 FAM124AQ86V42 546 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 PLD3Q8IV08 490 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 SLC30A8Q8IWU4 369 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 SETD9Q8NE22 299 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 LZICQ8WZA0 190 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 NEURL3Q96EH8 262 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 AICDAQ9GZX7 198 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 FGF22Q9HCT0 170 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 TAS2R7Q9NYW3 318 aa15□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 A0A0A6YYD5 115 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 OPN1SWP03999 348 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 AGXTP21549 392 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 GSTM2P28161 218 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 RRM2P31350 389 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 ZIC1Q15915 447 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 IFI44LQ53G44 452 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 USP30Q70CQ3 517 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 SPARTQ8N0X7 666 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 SPPL2AQ8TCT8 520 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 PDXPQ96GD0 296 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 ZNF347Q96SE7 839 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 THSD1Q9NS62 852 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 EBF1Q9UH73 591 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 PRSS38A1L453 326 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 POM121BA6NF01 834 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 SLC1A7O00341 560 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 IFNA14P01570 189 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 COL4A2P08572 1712 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 HTR1AP08908 422 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 CCDC159P0C7I6 412 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 ALDH9A1P49189 494 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 KIAA1024LP59773 190 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 DSTNP60981 165 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 ABATP80404 500 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 NEDD8Q15843 81 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 ADCK2Q7Z695 626 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 AMER3Q8N944 861 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 SGCDQ92629 289 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 SIPA1Q96FS4 1042 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 MYOCQ99972 504 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 SARGQ9BW04 601 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 RUBCNLQ9H714 662 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 NEUROD4Q9HD90 331 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 KRT84Q9NSB2 600 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.99□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.98□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 ADAMDEC1O15204 470 aa14.98□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 SEC14L2O76054 403 aa14.98□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 BCL6P41182 706 aa14.98□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 TUBA3CQ13748 450 aa14.98□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 MLC1Q15049 377 aa14.98□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.98□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.98□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.98□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.98□□□□□ -0.01
RNPS1-220ENST00000566458 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms