RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 PROM1O43490 865 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 HCRTR1O43613 425 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ATP5HO75947 161 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SLITRK5O94991 958 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ALBP02768 609 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SPTBP11277 2137 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 G6PDP11413 515 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ITGAXP20702 1163 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 DDCP20711 480 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 FBLP22087 321 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CPN2P22792 545 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PRDX6P30041 224 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 DIO3P55073 304 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 LIM2P55344 173 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 RAB38P57729 211 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 TAS2R50P59544 299 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 RAE1P78406 368 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 KLC1Q07866 573 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 C2orf80Q0P641 193 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 KRT72Q14CN4 511 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 COQ5Q5HYK3 327 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CPTPQ5TA50 214 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ANXA8L1Q5VT79 327 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 OR52E8Q6IFG1 317 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CAMKMTQ7Z624 323 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ZNF595Q8IYB9 648 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 DSELQ8IZU8 1212 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 RNF175Q8N4F7 328 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 C16orf78Q8WTQ4 265 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 COL26A1Q96A83 441 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 FKBP10Q96AY3 582 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 C10orf90Q96M02 699 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 C1orf50Q9BV19 199 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SLC25A23Q9BV35 468 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 TGIF2Q9GZN2 237 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 MYLK2Q9H1R3 596 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 REEP4Q9H6H4 257 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 RMND5AQ9H871 391 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 WDR54Q9H977 334 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 C14orf105Q9NVL8 296 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ASB4Q9Y574 426 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 C9J4A7 227 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 I3L1I5 382 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 MEN1O00255 615 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CHST10O43529 356 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 FOXS1O43638 330 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SH3BGRLO75368 114 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 EEDO75530 441 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 BMP10O95393 424 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 NPPAP01160 153 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 NR2F6P10588 404 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 IL1RNP18510 177 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 GPX3P22352 226 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CERS1P27544 350 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PLA2G5P39877 138 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 RASSF2P50749 326 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 HSD17B7P56937 341 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 TNFRSF17Q02223 184 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 OCA2Q04671 838 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 FAM71E1Q6IPT2 247 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CLNKQ7Z7G1 428 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 OR8J2Q8NGG1 315 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 OR9A4Q8NGU2 314 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ZFP28Q8NHY6 868 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 TBC1D20Q96BZ9 403 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PPCDCQ96CD2 204 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 TM4SF18Q96CE8 201 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 VPS50Q96JG6 964 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 CATSPER2Q96P56 530 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 TSSK3Q96PN8 268 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 MACROD1Q9BQ69 325 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 EBPLQ9BY08 206 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 ULBP3Q9BZM4 244 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 NMUR2Q9GZQ4 415 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 AICDAQ9GZX7 198 aa8.81□□□□□ -1
CS-220ENST00000550700 SLC26A1Q9H2B4 701 aa8.81□□□□□ -1
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