RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 TMIEQ8NEW7 156 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 BBS10Q8TAM1 723 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 F2RL3Q96RI0 385 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 TPK1Q9H3S4 243 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 ANGPTL1O95841 491 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 GJA4P35212 333 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 HOXD13P35453 343 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 STARP49675 285 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 NR4A3Q92570 626 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC3Q9BY71 257 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 ACTL7AQ9Y615 435 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 SH3PXD2BA1X283 911 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 FTCDNL1E5RQL4 147 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 YKT6O15498 198 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 ITM2AO43736 263 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 S1PR4O95977 384 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 GMFBP60983 142 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 ARFRP1Q13795 201 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC80Q76M96 950 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 OR4N5Q8IXE1 308 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 ACVR1CQ8NER5 493 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 RANBP9Q96S59 729 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM233B4DJY2 109 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 SPARCP09486 303 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 G6PDP11413 515 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 IL1RNP18510 177 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 HK1P19367 917 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 PROZP22891 400 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 MERTKQ12866 999 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM35AQ53FP2 167 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 GPR153Q6NV75 609 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 DPPA4Q7L190 304 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 LGI4Q8N135 537 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 ARRDC3Q96B67 414 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 LRCH3Q96II8 777 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 GPR22Q99680 433 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 OR51I1Q9H343 314 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 TRPV5Q9NQA5 729 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 NLGN3Q9NZ94 848 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 CAMK2AQ9UQM7 478 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 MYH13Q9UKX3 1938 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 CH25HO95992 272 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 AP3S2P59780 193 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 NPTX1Q15818 432 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 OCLNQ16625 522 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 LRIT3Q3SXY7 679 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF678Q5SXM1 525 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 ARL9Q6T311 187 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 PQLC1Q8N2U9 271 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 CPXM2Q8N436 756 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC17Q8N6Y2 441 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 OR5P2Q8WZ92 322 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 CHID1Q9BWS9 393 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 UCK2Q9BZX2 261 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 CA5BQ9Y2D0 317 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 A6NLC8 198 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF487B1APH4 448 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 GDF1P27539 372 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 SMSP52788 366 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 EMP2P54851 167 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 SLC7A9P82251 487 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 MADCAM1Q13477 382 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 IL18R1Q13478 541 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 SERINC2Q96SA4 455 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 DNAJB9Q9UBS3 223 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 FETUBQ9UGM5 382 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 NENFQ9UMX5 172 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 A0A0X1KG70 313 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 ECHS1P30084 290 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms