RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa9.32□□□□□ -0.92
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LPAR3Q9UBY5 353 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCMT1Q9UIC8 334 aa9.32□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa9.31□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.31□□□□□ -0.92
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.31□□□□□ -0.92
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa9.31□□□□□ -0.92
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TERF2Q15554 542 aa9.3□□□□□ -0.92
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC40Q9H9A6 602 aa9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PROK2Q9HC23 129 aa9.3□□□□□ -0.92
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CATSPERZQ9NTU4 200 aa9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa9.3□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HS3ST1O14792 307 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RCBTB2O95199 551 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 METTL18O95568 372 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV4-39P01824 125 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBP3P10745 1247 aa9.29□□□□□ -0.92
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
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