RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 SCELO95171 688 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR180Q86V85 440 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 PRSS58Q8IYP2 241 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM52Q8NDY8 209 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF304Q9HCX3 659 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 DAPP1Q9UN19 280 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 FREM2Q5SZK8 3169 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A088AWK7 358 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 MEN1O00255 615 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 RORAP35398 523 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ALDH9A1P49189 494 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP40Q5TG30 622 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 CLNKQ7Z7G1 428 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 OR51Q1Q8NH59 317 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF385DQ9H6B1 395 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 TRPC4Q9UBN4 977 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 CTSFQ9UBX1 484 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM33Q9UPN9 1127 aa21.48■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD28O15084 1053 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 PGRMC2O15173 223 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 IDO1P14902 403 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 MAPK1P28482 360 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 IL12AP29459 219 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 C2orf80Q0P641 193 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 PRSS53Q2L4Q9 553 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM69BQ5VUD6 431 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 CYB5D1Q6P9G0 228 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 STON2Q8WXE9 905 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 DDA1Q9BW61 102 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ROGDIQ9GZN7 287 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 PROM1O43490 865 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 AIFM1O95831 613 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 FBLP22087 321 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 GPX3P22352 226 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 TSFMP43897 325 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ABHD18Q0P651 414 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 SMU1Q2TAY7 513 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 VWA2Q5GFL6 755 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 COX15Q7KZN9 410 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC46A1Q96NT5 459 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ASIC5Q9NY37 505 aa21.47■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 H0YIG0 161 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 PRPS2P11908 318 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 CPN2P22792 545 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC5A2P31639 672 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 XCR1P46094 333 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 ARFIP1P53367 373 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 METTL21CQ5VZV1 264 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM71E1Q6IPT2 247 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 DSELQ8IZU8 1212 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 MIER2Q8N344 545 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 PROKR1Q8TCW9 393 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 BRINP2Q9C0B6 783 aa21.46■■□□□ 1.03
TSNARE1-208ENST00000524325 B4GALT2O60909 372 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 DCDP81605 110 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 ID2Q02363 134 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 CAMK2BQ13554 666 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 GSTA3Q16772 222 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM164Q5U3C3 297 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 OR4N5Q8IXE1 308 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 OR7A2PQ8NGA2 310 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 MR1Q95460 341 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 MVB12AQ96EY5 273 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 DPY30Q9C005 99 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 CHST8Q9H2A9 424 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 MYNNQ9NPC7 610 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC167Q9P0B6 97 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 CDC14AQ9UNH5 594 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 SEC16AO15027 2179 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1W2PS29 197 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 CYR61O00622 381 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 STX1BP61266 288 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 KLC1Q07866 573 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 DSG2Q14126 1118 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 MLIPQ5VWP3 458 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 PRMT9Q6P2P2 845 aa21.45■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 HBQ1P09105 142 aa21.44■■□□□ 1.02
TSNARE1-208ENST00000524325 ID4P47928 161 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms