RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	KRT87P	A6NCN2	255 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ACOT8	O14734	319 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PPM1D	O15297	605 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	RAD1	O60671	282 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	KCNH1	O95259	989 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PCNA	P12004	261 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CD1E	P15812	388 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SDC1	P18827	310 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SLC6A2	P23975	617 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	S100A3	P33764	101 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	NEK2	P51955	445 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SLC7A2	P52569	658 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	NME5	P56597	212 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SLC34A1	Q06495	639 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CDC20	Q12834	499 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	MAP7	Q14244	749 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	RCN1	Q15293	331 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	AVL9	Q8NBF6	648 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	APIP	Q96GX9	242 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TEX37	Q96LM6	180 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	QRFPR	Q96P65	431 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	S100A14	Q9HCY8	104 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	LRBA	P50851	2863 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131		A6NCN8	305 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ASPDH	A6ND91	283 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131		B4E171	279 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	KRT36	O76013	467 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PGR	P06401	933 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CDH1	P12830	882 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	F3	P13726	295 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	HPCAL1	P37235	193 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TSPAN7	P41732	249 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TRPC1	P48995	793 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CCNI	Q14094	377 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PTGR1	Q14914	329 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	FXN	Q16595	210 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ICE2	Q659A1	982 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	METTL4	Q8N3J2	472 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	NATD1	Q8N6N6	113 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	MIB2	Q96AX9	1013 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	MTERF3	Q96E29	417 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ITCH	Q96J02	903 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CENPK	Q9BS16	269 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SARG	Q9BW04	601 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	VCX3B	Q9H321	246 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PDP2	Q9P2J9	529 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TAC3	Q9UHF0	121 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CENPE	Q02224	2701 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131		A0A096LPI6	279 aa		11.08	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms