RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520166.5

TSNARE1-205, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-205ENST00000520166 TRIM8Q9BZR9 551 aa16.09■□□□□ 0.17
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TSNARE1-205ENST00000520166 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-205ENST00000520166 PDE7AQ13946 482 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-205ENST00000520166 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
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TSNARE1-205ENST00000520166 LCN10Q6JVE6 187 aa16.06■□□□□ 0.16
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