RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 MCEMP1Q8IX19 187 aa23■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa23■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 UBXN10Q96LJ8 280 aa23■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 CSF3RQ99062 836 aa23■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 PHACTR1Q9C0D0 580 aa23■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 DAPP1Q9UN19 280 aa23■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 MEMO1Q9Y316 297 aa23■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa22.99■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 C1QAP02745 245 aa22.99■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 CD22P20273 847 aa22.99■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 AGAP20933 346 aa22.99■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 SPRP35270 261 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 GPX6P59796 221 aa22.99■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 IRF8Q02556 426 aa22.99■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 RNFT1Q5M7Z0 435 aa22.99■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 GRTP1Q5TC63 336 aa22.99■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa22.99■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 PRM3Q9NNZ6 103 aa22.99■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 CREBBPQ92793 2442 aa22.99■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 TFECO14948 347 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 KCNC1P48547 511 aa22.98■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 CHIT1Q13231 466 aa22.98■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa22.98■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 RAPH1Q70E73 1250 aa22.98■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 SULF2Q8IWU5 870 aa22.98■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 PPM1NQ8N819 430 aa22.98■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 KCNC2Q96PR1 638 aa22.98■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 ROGDIQ9GZN7 287 aa22.98■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 ALG9Q9H6U8 611 aa22.98■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 NUDT4Q9NZJ9 180 aa22.98■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 CYR61O00622 381 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 ZFAND5O76080 213 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 IFNA16P05015 189 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 EPORP19235 508 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 STX2P32856 288 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 PTGER4P35408 488 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 MSH2P43246 934 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 SSR4P51571 173 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 GPR143P51810 404 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 PLTPP55058 493 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 CAV1Q03135 178 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.277e-16■■■■■ 47.1
ALYREF-203ENST00000511412 TBCCQ15814 346 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 CMC1Q7Z7K0 106 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC25Q86WR0 208 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 STAG3L4Q8TBR4 150 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 AGAP11Q8TF27 550 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 F2RL3Q96RI0 385 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 CD244Q9BZW8 370 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 RAB17Q9H0T7 212 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 ASB1Q9Y576 335 aa22.97■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 PRRG2O14669 202 aa22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 ZNHIT1O43257 154 aa22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 PEX1O43933 1283 aa22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 COX6B1P14854 86 aa22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 PTGER1P34995 402 aa22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 GMPRP36959 345 aa22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 BMPR2Q13873 1038 aa22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 EID3Q8N140 333 aa22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 UBE2E3Q969T4 207 aa22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 PHF12Q96QT6 1004 aa22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 MS4A8Q9BY19 250 aa22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 LYRM4Q9HD34 91 aa22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 PRDM7Q9NQW5 492 aa22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa22.96■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 CSMD1Q96PZ7 3565 aa22.95■■□□□ 1.27
ALYREF-203ENST00000511412 SUPT3HB4E1H0 165 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 CTNSO60931 367 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 SUPT3HO75486 399 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 FAM155BO75949 473 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 SLC35E2BP0CK96 405 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 RFC3P40938 356 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 LRBAP50851 2863 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 STX4Q12846 297 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 E2F2Q14209 437 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 GDF7Q7Z4P5 450 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 MDGA2Q7Z553 956 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 ABCA12Q86UK0 2595 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 TBCDQ9BTW9 1192 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 NMRAL1Q9HBL8 299 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 ERVK-11Q9UQG0 969 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 SPACA6W5XKT8 324 aa22.95■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 A8MVJ9 347 aa22.94■■□□□ 1.26
ALYREF-203ENST00000511412 KERAO60938 352 aa22.94■■□□□ 1.26
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