RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 SMIM23A6NLE4 172 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 H0YIV9 168 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 SMIM24O75264 130 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 SCELO95171 688 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 SSR2P43308 183 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TSFMP43897 325 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFSF10P50591 281 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 NEK2P51955 445 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 VSNL1P62760 191 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 EXT1Q16394 746 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ATCAYQ86WG3 371 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ACOT4Q8N9L9 421 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 L3MBTL4Q8NA19 623 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 M1APQ8TC57 530 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 MTBPQ96DY7 904 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM237Q96Q45 408 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD10Q9NXR5 420 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 KCMF1Q9P0J7 381 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 FETUBQ9UGM5 382 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 MMACHCQ9Y4U1 282 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRK2Q5S007 2527 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PPM1 405 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 UGDHO60701 494 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 MYO1DO94832 1006 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ICAM2P13598 275 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINB1P30740 379 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 CDH13P55290 713 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ID2Q02363 134 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC13A2Q13183 592 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TLR1Q15399 786 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 NR6A1Q15406 480 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ABHD17BQ5VST6 288 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 H3F3CQ6NXT2 135 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 GALNT11Q8NCW6 608 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ELP5Q8TE02 316 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 CMTM7Q96FZ5 175 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXW2Q9UKT8 454 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 EMCNQ9ULC0 261 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 V9GYY5 206 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 DYTNA2CJ06 578 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 LDB3O75112 727 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS4BO75351 444 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 EEDO75530 441 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 PYGBP11216 843 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 HPDP32754 393 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 PIK3CBP42338 1070 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNG1P51959 295 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 RAP1GDS1P52306 607 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TGM3Q08188 693 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM35AQ53FP2 167 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ACER2Q5QJU3 275 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 DEPDC1Q5TB30 811 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 LETMD1Q6P1Q0 360 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 APCDD1LQ8NCL9 501 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4F6Q8NGB9 312 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 OR1N1Q8NGS0 311 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TBCDQ9BTW9 1192 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 HES7Q9BYE0 225 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 LYRM4Q9HD34 91 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF225Q9UK10 706 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TMCO1Q9UM00 188 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS4AQ9UN37 437 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 HECTD1Q9ULT8 2610 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC18AA5D8T8 446 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5H15A6NDH6 313 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TMPRSS11DO60235 418 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 DLX3O60479 287 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN9O95484 217 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 HSD17B7P56937 341 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 AP2B1P63010 937 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 PMP22Q01453 160 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 LGSNQ5TDP6 509 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC18BQ6UXF7 455 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF595Q8IYB9 648 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC18CQ8NCF0 446 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2W6PQ8NHA6 318 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP2-218ENST00000511185 GRHL3Q8TE85 626 aa17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms