RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	MTTP	P55157	894 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	LIM2	P55344	173 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	HERVK_113	P63132	956 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLC	Q05315	142 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	NSDHL	Q15738	373 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PSMF1	Q92530	271 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CSF3R	Q99062	836 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	MFRP	Q9BY79	579 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	LHPP	Q9H008	270 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF225	Q9UK10	706 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	DAPP1	Q9UN19	280 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		14.88	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325		G3V2L1	256 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRMT3	O60678	531 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SUPT7L	O94864	414 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ETHE1	O95571	254 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PROC	P04070	461 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRR35	P0CG20	571 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	IMPDH1	P20839	514 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAOA	P21397	527 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	JAK1	P23458	1154 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SERPINB1	P30740	379 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CRHR1	P34998	444 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRKAA2	P54646	552 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	RAB38	P57729	211 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC18A2	Q05940	514 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SFT2D3	Q587I9	215 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CHSY3	Q70JA7	882 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CNPY4	Q8N129	248 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	MREG	Q8N565	214 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM47B	Q8NA70	645 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	KCNC2	Q96PR1	638 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	C5AR2	Q9P296	337 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	F8	P00451	2351 aa		14.87	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325		A0A088AWK7	358 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	WIPF3	A6NGB9	483 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CYR61	O00622	381 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLPP1	O14494	284 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR4F21	O95013	312 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SERPINA7	P05543	415 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ITGAM	P11215	1152 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	KRT4	P19013	534 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCT5	P48643	541 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TGM3	Q08188	693 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRABD2A	Q86V40	505 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	RGMA	Q96B86	450 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	REPS1	Q96D71	796 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	LUZP4	Q9P127	313 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		14.86	□□□□□ -0.03
PRKCZ-222	ENST00000496325	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		14.86	□□□□□ -0.03

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