RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493112.5

SUCLG2-204, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUCLG2, Length 1,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-204ENST00000493112 PRDM7Q9NQW5 492 aa11.64□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 ZNF358Q9NW07 568 aa11.64□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 SAP18O00422 153 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 CYR61O00622 381 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 LRRTM2O43300 516 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 NEURL1O76050 574 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 CLDN1O95832 211 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 CRYABP02511 175 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 EPB42P16452 691 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 TGM3Q08188 693 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 TECRLQ5HYJ1 363 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 SPINK14Q6IE38 97 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 GRHL2Q6ISB3 625 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 CEP128Q6ZU80 1094 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 B3GNT7Q8NFL0 401 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 OR7G3Q8NG95 312 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 SLC44A1Q8WWI5 657 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 UBE2E3Q969T4 207 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 KCNC2Q96PR1 638 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa11.63□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 CLDN4O14493 209 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 KLK8O60259 260 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 WISP2O76076 250 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 UNC5CO95185 931 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 TGFB1P01137 390 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 INHBAP08476 426 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 MYBL2P10244 700 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 SSR2P43308 183 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 MAGEA12P43365 314 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 MLF1P58340 268 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 PCDH1Q08174 1060 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 TERF2Q15554 542 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 C1QL3Q5VWW1 255 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 KLC3Q6P597 504 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 GFRALQ6UXV0 394 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 ZNF595Q8IYB9 648 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 DNAJB8Q8NHS0 232 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 NCLNQ969V3 563 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 ISL2Q96A47 359 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 TBCDQ9BTW9 1192 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 DEFB126Q9BYW3 111 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 ROGDIQ9GZN7 287 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 OR51B5Q9H339 312 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 ADAP2Q9NPF8 381 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 KCMF1Q9P0J7 381 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 LRFN1Q9P244 771 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa11.62□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 CCDC189A1A4V9 331 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 SLC25A12O75746 678 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 SCELO95171 688 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 STSP08842 583 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 CD46P15529 392 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 SERPINB1P30740 379 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 CLCN2P51788 898 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 GTF2H2Q13888 395 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP11.61□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 33.8
SUCLG2-204ENST00000493112 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 TAOK1Q7L7X3 1001 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 FJX1Q86VR8 437 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 ZNF227Q86WZ6 799 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 ACOT4Q8N9L9 421 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 HUS1BQ8NHY5 278 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 VMP1Q96GC9 406 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 TSPYL1Q9H0U9 437 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 ACTR8Q9H981 624 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 LYRM4Q9HD34 91 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 DMRT3Q9NQL9 472 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 XPR1Q9UBH6 696 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 SEC14L3Q9UDX4 400 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 EML6Q6ZMW3 1958 aa11.61□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 ASPDHA6ND91 283 aa11.6□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa11.6□□□□□ -0.55
SUCLG2-204ENST00000493112 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms