RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 IL23RQ5VWK5 629 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 CYP20A1Q6UW02 462 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 UBE3DQ7Z6J8 389 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 TMEM126BQ8IUX1 230 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 RNF175Q8N4F7 328 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 NATD1Q8N6N6 113 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ACOT4Q8N9L9 421 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 MTERF3Q96E29 417 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 OR52B2Q96RD2 323 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 EBF4Q9BQW3 602 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 FAIM2Q9BWQ8 316 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SEMA4CQ9C0C4 833 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 KLHL31Q9H511 634 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 SYNPO2LQ9H987 977 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 OCIAD1Q9NX40 245 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-211ENST00000488243 A0A0A6YYD5 115 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 DYTNA2CJ06 578 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 ZNF749O43361 778 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 KLHL18O94889 574 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 WISP1O95388 367 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 KLK1P06870 262 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 BCKDHAP12694 445 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 DRD2P14416 443 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 PRPS1L1P21108 318 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 CD82P27701 267 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 MAPK12P53778 367 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 BTN3A2P78410 334 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 CBX1P83916 185 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 BIKQ13323 160 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 MAP7Q14244 749 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 SQLEQ14534 574 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 DPY19L1Q2PZI1 675 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 BROXQ5VW32 411 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 ZNF248Q8NDW4 579 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 TSPEARQ8WU66 669 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 PPP1R36Q96LQ0 422 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 C10orf90Q96M02 699 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 AICDAQ9GZX7 198 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 WDR41Q9HAD4 459 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 MYNNQ9NPC7 610 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 LHX9Q9NQ69 397 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 AIG1Q9NVV5 245 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 EHD3Q9NZN3 535 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 ZIM2Q9NZV7 527 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 HEY2Q9UBP5 337 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 RP1P56715 2156 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 PTPN13Q12923 2485 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 UNC79Q9P2D8 2635 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 B8ZZF3 427 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 E9PBE3 544 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 SAP18O00422 153 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 NVLO15381 856 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 FOXS1O43638 330 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 KLHL41O60662 606 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 TBX19O60806 448 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 CYC1P08574 325 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 FAM58BPP0C7Q3 252 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 CCL4P13236 92 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 RNH1P13489 461 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 SDC1P18827 310 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 AGXTP21549 392 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 CLDN8P56748 225 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 TMPRSS3P57727 454 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 RAB8AP61006 207 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 RAE1P78406 368 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 RHDQ02161 417 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 ABHD18Q0P651 414 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 LRRC74AQ0VAA2 488 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 SLAMF1Q13291 335 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 DSG2Q14126 1118 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-211ENST00000488243 DEFB134Q4QY38 66 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms