RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.77□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 POLQO75417 2590 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRRD1A4D1F6 860 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 BTN3A3O00478 584 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 SUN1O94901 812 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLEC3BP05452 202 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 UMODP07911 640 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 RALBP11234 206 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 PORP16435 677 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 RBL1P28749 1068 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 GGT5P36269 586 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 PGM1P36871 562 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRKCIP41743 596 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRKAG1P54619 331 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARG2P78540 354 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 RHBDD2Q6NTF9 364 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 SARM1Q6SZW1 724 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 PXKQ7Z7A4 578 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRIM73Q86UV7 250 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 RFX6Q8HWS3 928 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 HM13Q8TCT9 377 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 VPS50Q96JG6 964 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 RNF157Q96PX1 679 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 NRTNQ99748 197 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 LHPPQ9H008 270 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 ASB8Q9H765 288 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 HACD3Q9P035 362 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 IL17CQ9P0M4 197 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 PSAT1Q9Y617 370 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPTBP11277 2137 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 F8P00451 2351 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 CYP1A2P05177 515 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 MMP11P24347 488 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 KDELR1P24390 212 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 TAS2R40P59535 323 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 DYNLT1P63172 113 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF844Q08AG5 666 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCNIQ14094 377 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 PTPRCAPQ14761 206 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 SEC23BQ15437 767 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBCCQ15814 346 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 RBBP7Q16576 425 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 TEX44Q53QW1 395 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 MTFR2Q6P444 385 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPESP1Q6UW49 350 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 ISLR2Q6UXK2 745 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 PID1Q7Z2X4 250 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 IPMKQ8NFU5 416 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 RAPGEF5Q92565 580 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLX1AQ9BQ83 275 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM60AQ9NP50 221 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 POLEQ07864 2286 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 SEC16AO15027 2179 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 C2orf81A6NN90 581 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 AGAP14A8MT82 685 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 SRP72O76094 671 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 PROSCO94903 275 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 NADKO95544 446 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 F10P00742 488 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 TNNT1P13805 278 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 UGT2B7P16662 529 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms