RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477886.5

PRKRIP1-205, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKRIP1, Length 986 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-205ENST00000477886 RCN2Q14257 317 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 IL20RBQ6UXL0 311 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 ARMC10Q8N2F6 343 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM57AQ8TBR7 257 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 QRFPRQ96P65 431 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 CSF3RQ99062 836 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 DEFB127Q9H1M4 99 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 NT5DC2Q9H857 520 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.14■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 WWP2O00308 870 aa22.13■■□□□ 1.13
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PRKRIP1-205ENST00000477886 STK16O75716 305 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 OR2J2O76002 312 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 TUBB4AP04350 444 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 STMN1P16949 149 aa22.13■■□□□ 1.13
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PRKRIP1-205ENST00000477886 LIM2P55344 173 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 CALCOCO2Q13137 446 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 DOC2AQ14183 400 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 PDK4Q16654 411 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 SULT1C3Q6IMI6 304 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 BBOF1Q8ND07 529 aa22.13■■□□□ 1.13
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PRKRIP1-205ENST00000477886 F2RL3Q96RI0 385 aa22.13■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 RNF112Q9ULX5 631 aa22.13■■□□□ 1.13
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PRKRIP1-205ENST00000477886 GTF3C1Q12789 2109 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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PRKRIP1-205ENST00000477886 SH3BGRLO75368 114 aa22.12■■□□□ 1.13
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PRKRIP1-205ENST00000477886 OR4D1Q15615 310 aa22.12■■□□□ 1.13
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PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 PSD4Q8NDX1 1056 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 OR52N2Q8NGI0 321 aa22.12■■□□□ 1.13
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PRKRIP1-205ENST00000477886 OR8D2Q9GZM6 311 aa22.12■■□□□ 1.13
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PRKRIP1-205ENST00000477886 EFCAB11Q9BUY7 163 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 EHD1Q9H4M9 534 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 SPACA6W5XKT8 324 aa22.11■■□□□ 1.13
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PRKRIP1-205ENST00000477886 LDB3O75112 727 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 OR6B1O95007 311 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 PCNAP12004 261 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 SOX3P41225 446 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 KCNC1P48547 511 aa22.1■■□□□ 1.13
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PRKRIP1-205ENST00000477886 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.136e-9■□□□□ 8.2
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PRKRIP1-205ENST00000477886 MCMBPQ9BTE3 642 aa22.1■■□□□ 1.13
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PRKRIP1-205ENST00000477886 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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PRKRIP1-205ENST00000477886 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 CYR61O00622 381 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 PRAMEF4O60810 478 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 GGT5P36269 586 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKRIP1-205ENST00000477886 GPR143P51810 404 aa22.09■■□□□ 1.13
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