RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-208ENST00000455631 PRIMA1Q86XR5 153 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 SLC5A11Q8WWX8 675 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 NEIL2Q969S2 332 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 TSNARE1Q96NA8 513 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 NDNQ99608 321 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 NEUROD4Q9HD90 331 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 ADAP2Q9NPF8 381 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 SACM1LQ9NTJ5 587 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 ARL15Q9NXU5 204 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 SPRR3Q9UBC9 169 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 TGFBR3LH3BV60 316 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 DVL2O14641 736 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 SMIM10L1P0DMW3 83 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 SARNPP82979 210 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 REEP5Q00765 189 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 BMPR2Q13873 1038 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 ARMC3Q5W041 872 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 UGT3A1Q6NUS8 523 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 HSDL2Q6YN16 418 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 ANKRD53Q8N9V6 530 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 TRPV3Q8NET8 790 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 OR56A3Q8NH54 315 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 SMIM10Q96HG1 83 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 HAUS5O94927 633 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 P04436 131 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 HK2P52789 917 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 BTN3A2P78410 334 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 FOXO1Q12778 655 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 CLNKQ7Z7G1 428 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 GOLM1Q8NBJ4 401 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 LINGO1Q96FE5 620 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 FBXO5Q9UKT4 447 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 CLDN16Q9Y5I7 305 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 A0A0G2JN53 185 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 FAM171A2A8MVW0 826 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 CLDN4O14493 209 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 NRDCO43847 1150 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 HCN1O60741 890 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 IFNA16P05015 189 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 CCL3P10147 92 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 SAT1P21673 171 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 HSD17B7P56937 341 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 DCAF7P61962 342 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 CCZ1BP86790 482 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.036e-6■□□□□ 10.3
PTPRA-208ENST00000455631 HYAL4Q2M3T9 481 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 SEM1Q6ZVN7 128 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 TMPRSS11BQ86T26 416 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 FAM47BQ8NA70 645 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 NAXEQ8NCW5 288 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM52Q8NDY8 209 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 CALML6Q8TD86 181 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 FAR2Q96K12 515 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 AIF1LQ9BQI0 150 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 ATG4BQ9Y4P1 393 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 MPDZO75970 2070 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 TUBAL3A6NHL2 446 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 SERPINA6P08185 405 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 KCNJ1P48048 391 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 VPS41P49754 854 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 RUNX2Q13950 521 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 PAQR3Q6TCH7 311 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 LMNTD2Q8IXW0 634 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 ULK2Q8IYT8 1036 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 TXLNBQ8N3L3 684 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 FBXW8Q8N3Y1 598 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 LRRN4CLQ8ND94 238 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 CAPZA3Q96KX2 299 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 SGCZQ96LD1 299 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 DESI2Q9BSY9 194 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 AICDAQ9GZX7 198 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 DYRK1BQ9Y463 629 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRA-208ENST00000455631 GUCA1CO95843 209 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRA-208ENST00000455631 AP1S2P56377 157 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRA-208ENST00000455631 RAB38P57729 211 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRA-208ENST00000455631 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRA-208ENST00000455631 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
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