RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC45A3Q96JT2 553 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 QRFPRQ96P65 431 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 SERINC2Q96SA4 455 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 YIPF2Q9BWQ6 316 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 AHSPQ9NZD4 102 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 TRPC4Q9UBN4 977 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 TIMM22Q9Y584 194 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 CFAP46Q8IYW2 2715 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 SERTM1A2A2V5 107 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 VSTM2BA6NLU5 285 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 AZIN1O14977 448 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC28A2O43868 658 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 SEMA3DO95025 777 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 HSPA4LO95757 839 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 RECKO95980 971 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CHRNGP07510 517 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ATXN8OSP0DMR3 200 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 BGNP21810 368 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 F8A1P23610 371 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 TSFMP43897 325 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 MTTPP55157 894 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 MC1RQ01726 317 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 STX3Q13277 289 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4C11Q6IEV9 310 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE3DQ7Z6J8 389 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CLYBLQ8N0X4 340 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 MIPOL1Q8TD10 442 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNA7Q96RP8 456 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 TGIF2Q9GZN2 237 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 PRDM7Q9NQW5 492 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 IL17BQ9UHF5 180 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ENO4A6NNW6 628 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 C4orf51C9J302 202 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 B3GALT2O43825 422 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 SH3BGRLO75368 114 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 RDH16O75452 317 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CHEK2O96017 543 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 B3GALT4O96024 378 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 FOXA1P55317 472 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 NKG7Q16617 165 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ATG16L1Q676U5 607 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 KIRREL3Q8IZU9 778 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 OR51Q1Q8NH59 317 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM81AQ8TBF8 368 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 STT3BQ8TCJ2 826 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 EXTL1Q92935 676 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ACTL8Q9H568 366 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 C14orf105Q9NVL8 296 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CTSFQ9UBX1 484 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 TCFL5Q9UL49 500 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAF6Q9Y4K3 522 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A0G2JN53 185 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF860A6NHJ4 632 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 SAP18O00422 153 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CHST10O43529 356 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CREG1O75629 220 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ETHE1O95571 254 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ZGLP1P0C6A0 271 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 SSR2P43308 183 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC1A6P48664 564 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ABRAXAS2Q15018 415 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 TBR1Q16650 682 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 KANK2Q63ZY3 851 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF165Q6ZSG1 346 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2Y1Q8NGV0 311 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 STARD8Q92502 1023 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 OR1F2PQ96R84 312 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CLMPQ9H6B4 373 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 HCN3Q9P1Z3 774 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 VPS29Q9UBQ0 182 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 FER1L5A0AVI2 2057 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 PLPP1O14494 284 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 ITM2AO43736 263 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 SCELO95171 688 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 WISP1O95388 367 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-205ENST00000450873 RNH1P13489 461 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms