RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 PROP1O75360 226 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ECI2O75521 394 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 SERPINI2O75830 405 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 LATS1O95835 1130 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 MBD3O95983 291 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 MT-ND1P03886 318 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF735P0CB33 412 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF23P17027 643 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CDH3P22223 829 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CERS1P27544 350 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 GJB2P29033 226 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ALDH1B1P30837 517 aa4.28□□□□□ -1.72
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CBX1P4-201ENST00000439415 AHRP35869 848 aa4.28□□□□□ -1.72
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CBX1P4-201ENST00000439415 THOP1P52888 689 aa4.28□□□□□ -1.72
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CBX1P4-201ENST00000439415 ASPHD2Q6ICH7 369 aa4.28□□□□□ -1.72
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CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.28□□□□□ -1.72
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CBX1P4-201ENST00000439415 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
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CBX1P4-201ENST00000439415 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 OR6M1Q8NGM8 313 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 OR8J1Q8NGP2 316 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 OR4L1Q8NH43 312 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 MTBPQ96DY7 904 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 PHF21BQ96EK2 531 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ABHD8Q96I13 439 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 C3orf30Q96M34 536 aa4.28□□□□□ -1.72
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CBX1P4-201ENST00000439415 S1PR3Q99500 378 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC25A33Q9BSK2 321 aa4.28□□□□□ -1.72
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CBX1P4-201ENST00000439415 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa4.28□□□□□ -1.72
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CBX1P4-201ENST00000439415 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
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CBX1P4-201ENST00000439415 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa4.28□□□□□ -1.72
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CBX1P4-201ENST00000439415 OR2W1Q9Y3N9 320 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ETV7Q9Y603 341 aa4.28□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCA8O94911 1581 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF804BA4D1E1 1349 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa4.27□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 TXNDC12O95881 172 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SERPINA3P01011 423 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CSF2P04141 144 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 GP1BBP13224 206 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF20P17024 532 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 RFC4P35249 363 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ACADVLP49748 655 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CNTN2Q02246 1040 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SP3Q02447 781 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 GTF2H2Q13888 395 aa4.27□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 PTGR1Q14914 329 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 MPPE1Q53F39 396 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC35D3Q5M8T2 416 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 MANEAQ5SRI9 462 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 LIPKQ5VXJ0 399 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SEL1L3Q68CR1 1132 aa4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa4.27□□□□□ -1.73
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