RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 ITGA2P17301 1181 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGFBP5P24593 272 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 CA5AP35218 305 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCGF2P35227 344 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 IL12RB1P42701 662 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAGEA2P43356 314 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 ALDH3B2P48448 385 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 HLCSP50747 726 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBBP4Q09028 425 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 TUBA3CQ13748 450 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 KEAP1Q14145 624 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 E2F2Q14209 437 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 RTP5Q14D33 572 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 VMACQ2NL98 169 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM215Q68D42 235 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF773Q6PK81 442 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 DOK6Q6PKX4 331 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 LCTLQ6UWM7 567 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP51Q70EK9 711 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 TBC1D19Q8N5T2 526 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARL10Q8N8L6 244 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR7G3Q8NG95 312 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR2L2Q8NH16 312 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 WDR34Q96EX3 536 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 APIPQ96GX9 242 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 POM121Q96HA1 1249 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 PKP4Q99569 1192 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 EBPLQ9BY08 206 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 HDAC8Q9BY41 377 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBRSQ9HAH7 460 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYNNQ9NPC7 610 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 GMEB1Q9Y692 573 aa6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 KNL1Q8NG31 2342 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1B0GVT2 93 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM247A6NEH6 219 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 AREL1O15033 823 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADAMDEC1O15204 470 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 SUV39H1O43463 412 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 HS6ST1O60243 411 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 NOBOXO60393 691 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 DPM1O60762 260 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 SEMA3DO95025 777 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRATO95237 230 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 FKBP9O95302 570 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNAP29O95721 258 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 MT-ND1P03886 318 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 CISD3P0C7P0 127 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 ETS2P15036 469 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPX2P18283 190 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 FPR1P21462 350 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 GSTM2P28161 218 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 TEAD1P28347 426 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 CD6P30203 668 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 NTSR1P30989 418 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 SOX11P35716 441 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 PREPP48147 710 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 NEK2P51955 445 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 CTSCP53634 463 aa6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P1-201ENST00000437111 ITGA1P56199 1179 aa6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms