RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416893.2

ATG4AP1-201, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene ATG4AP1, Length 538 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AP1-201ENST00000416893 CEACAM1P13688 526 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 ZNF30P17039 623 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 PSMB4P28070 264 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 CRABP2P29373 138 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 HNF1BP35680 557 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 GRK6P43250 576 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 STC1P52823 247 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 SSTP61278 116 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 RPS16P62249 146 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 LRRC74AQ0VAA2 488 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 FOXF2Q12947 444 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 BMPR2Q13873 1038 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 ARHGEF7Q14155 803 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 GNA13Q14344 377 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 GALNT3Q14435 633 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 NFATC4Q14934 902 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 TBCCQ15814 346 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 KLHL38Q2WGJ6 581 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 ZNF542PQ5EBM4 170 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 C3orf38Q5JPI3 329 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 METTL11BQ5VVY1 283 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 METTL21CQ5VZV1 264 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 KDELC1Q6UW63 502 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 MACC1Q6ZN28 852 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 PID1Q7Z2X4 250 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 KDELC2Q7Z4H8 507 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 PARGQ86W56 976 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 GATAD2AQ86YP4 633 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 MREGQ8N565 214 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 FAM71DQ8N9W8 422 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 SAP25Q8TEE9 199 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 NAT14Q8WUY8 206 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 ATG4AQ8WYN0 398 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 RFKQ969G6 155 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 SGF29Q96ES7 293 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 DTD2Q96FN9 168 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 SPATA13Q96N96 652 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 CAMK1GQ96NX5 476 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 LYSMD1Q96S90 227 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 CDRT15Q96T59 188 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 VAT1Q99536 393 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 TUBA1CQ9BQE3 449 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 FERMT1Q9BQL6 677 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 ERP44Q9BS26 406 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 RAB17Q9H0T7 212 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 SLC32A1Q9H598 525 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 USP29Q9HBJ7 922 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 PLGRKTQ9HBL7 147 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 FAM114A2Q9NRY5 505 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 DNPEPQ9ULA0 475 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 IFT52Q9Y366 437 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 OR1A2Q9Y585 309 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 FLNCQ14315 2725 aa4.7□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 BSNQ9UPA5 3926 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 OR6C65A6NJZ3 312 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 ANKRD66B4E2M5 251 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 BET1O15155 118 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 PFDN6O15212 129 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 FFAR2O15552 330 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 LIASO43766 372 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 TSC22D2O75157 780 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 PIAS2O75928 621 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 ANXA9O76027 345 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 KLHL2O95198 593 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 OR5F1O95221 314 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 CLDN7O95471 211 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 SOD1P00441 154 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 FGGP02679 453 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 SLC4A1P02730 911 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 CSF2P04141 144 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 ALOX5P09917 674 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 RHOXF2BP0C7M4 288 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 NR1D1P20393 614 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 DGKAP23743 735 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 TEAD1P28347 426 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 PIK3CBP42338 1070 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 MSH2P43246 934 aa4.69□□□□□ -1.66
ATG4AP1-201ENST00000416893 GSSP48637 474 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms