RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 WWOXQ9NZC7 414 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GALPQ9UBC7 116 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CD84Q9UIB8 345 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SARDHQ9UL12 918 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SCML1Q9UN30 329 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ITM2BQ9Y287 266 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SDK2Q58EX2 2172 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 APCP25054 2843 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 BBIP1A8MTZ0 92 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 A8MX80 341 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 K7EPI3 171 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PIP5K1BO14986 540 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SGTAO43765 313 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 VEGFDO43915 354 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ZNF217O75362 1048 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GPC4O75487 556 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 WDR47O94967 919 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KRT16P08779 473 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PRR35P0CG20 571 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RNF224P0DH78 156 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 THRAP10827 490 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PIK3R1P27986 724 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CCR7P32248 378 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RAP1GDS1P52306 607 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TRAF3Q13114 568 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SNCBQ16143 134 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RBBP7Q16576 425 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PHKG1Q16816 387 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RABL3Q5HYI8 236 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 COQ5Q5HYK3 327 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 IL27RAQ6UWB1 636 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 C16orf89Q6UX73 402 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RFLNAQ6ZTI6 216 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CHPFQ8IZ52 775 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 OR2T3Q8NH03 318 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 HM13Q8TCT9 377 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TRPC4APQ8TEL6 797 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ELMO1Q92556 727 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SCAMP4Q969E2 229 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TMEM159Q96B96 161 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 EGFL8Q99944 293 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 HGH1Q9BTY7 390 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PARVBQ9HBI1 364 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 OPTCQ9UBM4 332 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MED13LQ71F56 2210 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 A0A0A6YYJ9 748 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GFYI3L273 518 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 UBDO15205 165 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 UGDHO60701 494 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CIB2O75838 187 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TM7SF2O76062 418 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SLCO2B1O94956 709 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MATN4O95460 622 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CATP04040 527 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 EBLN1P0CF75 366 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 COX4I1P13073 169 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms