RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408189.1

SNORD110-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 110, humanhuman

BASIC

Gene SNORD110, Length 75 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleolus, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD110-201ENST00000408189 MNAT1P51948 309 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 MAPK12P53778 367 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 PNLIPRP2P54317 469 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 BTG1P62324 171 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 RBBP4Q09028 425 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 RALGDSQ12967 914 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 PRKG2Q13237 762 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 CUL3Q13618 768 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 PDE7AQ13946 482 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 MED22Q15528 200 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 NPTX1Q15818 432 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 CNPY1Q3B7I2 92 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 C14orf28Q4W4Y0 310 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 SBK1Q52WX2 424 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 ZNF311Q5JNZ3 666 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 TATDN1Q6P1N9 297 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 TEX38Q6PEX7 206 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 MFSD7Q6UXD7 560 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 MACC1Q6ZN28 852 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 DET1Q7L5Y6 550 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 ZNF695Q8IW36 515 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 TEX11Q8IYF3 940 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 FBXO39Q8N4B4 442 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 SAMD12Q8N8I0 201 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 DCAF4L2Q8NA75 395 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 XXYLT1Q8NBI6 393 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 CLEC1AQ8NC01 280 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 MDS2Q8NDY4 140 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 BBS1Q8NFJ9 593 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 NEIL3Q8TAT5 605 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 SLC22A8Q8TCC7 542 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 ATL1Q8WXF7 558 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 CCT6BQ92526 530 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 RMI2Q96E14 147 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 SPDL1Q96EA4 605 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 LINC00477Q96M19 166 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 NDNQ99608 321 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 AGXT2Q9BYV1 514 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 PRRG4Q9BZD6 226 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 ULBP2Q9BZM5 246 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 HRH4Q9H3N8 390 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 LIME1Q9H400 295 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 SH2D4AQ9H788 454 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 NT5DC2Q9H857 520 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 GORASP2Q9H8Y8 452 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 NMUR1Q9HB89 426 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 SH3GLB2Q9NR46 395 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 CLIC5Q9NZA1 410 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 DPM3Q9P2X0 92 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 OPN4Q9UHM6 478 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 SLC13A4Q9UKG4 626 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 TBX21Q9UL17 535 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 PLAGL1Q9UM63 463 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 PDE10AQ9Y233 779 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 GPR52Q9Y2T5 361 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 KAT6BQ8WYB5 2073 aa-0.04□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 PARD3Q8TEW0 1356 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 ACEP12821 1306 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 BAHCC1Q9P281 2608 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 A0A096LNJ9 63 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 NKX2-6A6NCS4 301 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 SLC15A5A6NIM6 579 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 USP27XA6NNY8 438 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 RNF212BA8MTL3 300 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 MYO1GB0I1T2 1018 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 C17orf105B2RV13 164 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 ZNF878C9JN71 531 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 PTGESO14684 152 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 BET1O15155 118 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 PRC1O43663 620 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 ATP6AP2O75787 350 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 BBOX1O75936 387 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 TMEM63AO94886 807 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 MBD4O95243 580 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 TGDSO95455 350 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 MT-ND2P03891 347 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 POLBP06746 335 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 CSN3P07498 182 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 RAB40ALP0C0E4 278 aa-0.05□□□□□ -2.42
SNORD110-201ENST00000408189 SBK2P0C263 348 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms