RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 TSNQ15631 228 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CCDC91Q7Z6B0 441 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ZNF227Q86WZ6 799 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SULF2Q8IWU5 870 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CTAGE3PQ8IX95 158 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ARMC10Q8N2F6 343 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 LRRN4CLQ8ND94 238 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 TRPV3Q8NET8 790 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SLC5A11Q8WWX8 675 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 RND1Q92730 232 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 RHBDF1Q96CC6 855 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 TXLNGYQ9BZA5 131 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 RHBGQ9H310 441 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CCDC189A1A4V9 331 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 FAM90A27PA6NNH2 459 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 HS6ST1O60243 411 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 DNAJB6O75190 326 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 MYO1DO94832 1006 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 B3GALT4O96024 378 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ABHD2P08910 425 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CCDC166P0CW27 439 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 TFEBP19484 476 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 HNF4AP41235 474 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SCTRP47872 440 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CLCN2P51788 898 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SLC12A2P55011 1212 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 RAB8AP61006 207 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 DLG1Q12959 904 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 E2F2Q14209 437 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 TERF2Q15554 542 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 OR4D1Q15615 310 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CMPK2Q5EBM0 449 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CATSPEREQ5SY80 951 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CMC1Q7Z7K0 106 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 PDPRQ8NCN5 879 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 B3GNT7Q8NFL0 401 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SLC44A1Q8WWI5 657 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 NEIL2Q969S2 332 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 KIAA1191Q96A73 305 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 TSNARE1Q96NA8 513 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 AIF1LQ9BQI0 150 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CCDC77Q9BR77 488 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 KCNJ16Q9NPI9 418 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 FBXW2Q9UKT8 454 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 DYRK1BQ9Y463 629 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ZFHX3Q15911 3703 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SPG11Q96JI7 2443 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 A8MUA0 341 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 TAPBPO15533 448 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ITGA10O75578 1167 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 GUCA1CO95843 209 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 IGFBP2P18065 325 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 CRABP2P29373 138 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SSR4P51571 173 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 GPR85P60893 370 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 REEP5Q00765 189 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SLMAPQ14BN4 828 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 PAOXQ6QHF9 649 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ISCA2Q86U28 154 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 TMEM200AQ86VY9 491 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 IFT20Q8IY31 132 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 MARVELD2Q8N4S9 558 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 APCDD1LQ8NCL9 501 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 LILRB4Q8NHJ6 448 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 C16orf52Q8NHV5 167 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 IFT81Q8WYA0 676 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 VMP1Q96GC9 406 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ATOH8Q96SQ7 321 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ZNF559Q9BR84 538 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 TMEM79Q9BSE2 394 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SLC6A16Q9GZN6 736 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SPNS1Q9H2V7 528 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 PELI2Q9HAT8 420 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SLC24A3Q9HC58 644 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 NECTIN3Q9NQS3 549 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ZNF180Q9UJW8 692 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 NFU1Q9UMS0 254 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ERVK-11Q9UQG0 969 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 RNF6Q9Y252 685 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 MMACHCQ9Y4U1 282 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ITPR3Q14573 2671 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 NKX2-6A6NCS4 301 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ACOT7O00154 380 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 PDE9AO76083 593 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 ACSL3O95573 720 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 SERPINA6P08185 405 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 MSX1P28360 303 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-204ENST00000403441 GMPRP36959 345 aa11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms