RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CAPZA1P52907 286 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CDH11P55287 796 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OR4D2P58180 307 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SSTP61278 116 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PLP2Q04941 152 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GARNL3Q5VVW2 1013 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 AMZ2Q86W34 360 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OR4K17Q8NGC6 315 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SMPDL3BQ92485 455 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA1191Q96A73 305 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NPIPA5E9PKD4 350 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FARS2O95363 451 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OAS1P00973 400 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CELP19835 753 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 LCN1P31025 176 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CCR8P51685 355 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 E2F1Q01094 437 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC66Q68CR7 880 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FOXRED2Q8IWF2 684 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SUSD3Q96L08 255 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DPYSL5Q9BPU6 564 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SLC32A1Q9H598 525 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NPIPA1Q9UND3 350 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MAB21L2Q9Y586 359 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 H3BSH0 61 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 J3QLW9 94 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MANBAO00462 879 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF19P17023 458 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PTPN2P17706 415 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ACVRL1P37023 503 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 HTR2BP41595 481 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CRISP1P54107 249 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PLGLB1Q02325 96 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FBXL22Q6P050 247 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 BORAQ6PGQ7 559 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 KCT2Q8NC54 265 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 COQ8AQ8NI60 647 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MAPK15Q8TD08 544 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 S100PBPQ96BU1 408 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF285Q96NJ3 590 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RDH12Q96NR8 316 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SYT17Q9BSW7 474 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 Q9N2J8 555 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GHRLQ9UBU3 117 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CDH10Q9Y6N8 788 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 LCHNA4D1U4 455 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MEN1O00255 615 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ATG12O94817 140 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PCCBP05166 539 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 STSP08842 583 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 EDNRAP25101 427 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OPRL1P41146 370 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NR4A2P43354 598 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 S100A10P60903 97 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NCEH1Q6PIU2 408 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 C12orf40Q86WS4 652 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NXPE1Q8N323 547 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RGMAQ96B86 450 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF599Q96NL3 588 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TAS2R10Q9NYW0 307 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0U1RQF3 1178 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 IL7P13232 177 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RGS19P49795 217 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ST3GAL3Q11203 375 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CLCA4Q14CN2 919 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SPATS1Q496A3 300 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SPIN4Q56A73 249 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PIGGQ5H8A4 983 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.55□□□□□ -1.04
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