RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 PROZP22891 400 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 KCNC4Q03721 635 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC2A13Q96QE2 648 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 CMKLR1Q99788 373 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 TRIM74Q86UV6 250 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 GALNT12Q8IXK2 581 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 ABCG2Q9UNQ0 655 aa20.62■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 E7ESA3 106 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 AHSA1O95433 338 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 OR2M4Q96R27 311 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 RANBP9Q96S59 729 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 SPEF1Q9Y4P9 236 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 CDH10Q9Y6N8 788 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 SOCS5O75159 536 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 PDYNP01213 254 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 MAGEA2P43356 314 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 CLRN1P58418 232 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 TGM7Q96PF1 710 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 TTC34A8MYJ7 566 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC16A5O15375 505 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 SNAP29O95721 258 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 CNIH3Q8TBE1 160 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 E7EQ34 232 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 CCRL2O00421 344 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 COCHO43405 550 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 S100A10P60903 97 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 ZFAND2BQ8WV99 257 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 EEDO75530 441 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 LEFTY1O75610 366 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 SYPP08247 313 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 FBLP22087 321 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 GRIA2P42262 883 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 GID4Q8IVV7 300 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 OR4K1Q8NGD4 311 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 OTUB2Q96DC9 234 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 DISC1C4P0D8 188 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 PROM1O43490 865 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 DUX1O43812 170 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 OR7A10O76100 309 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 C7P10643 843 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 GRB7Q14451 532 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 ORAI3Q9BRQ5 295 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 SUSD2Q9UGT4 822 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC35F4A4IF30 521 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM72CH0Y354 149 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF805Q5CZA5 627 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 RAB12Q6IQ22 244 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 TRIM73Q86UV7 250 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM72BQ86X60 149 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 LAMP5Q9UJQ1 280 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 WDR45Q9Y484 360 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 ITGA5P08648 1049 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 MPC1LP0DKB6 136 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 PEX13Q92968 403 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC45A3Q96JT2 553 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 ACRV1P26436 265 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 JAG1P78504 1218 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 FOXK1P85037 733 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 SPIN3Q5JUX0 258 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 BRF2Q9HAW0 419 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD28-201ENST00000399451 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms