RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 NBL1P41271 181 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 TSFMP43897 325 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 ARFIP1P53367 373 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 SLC14A1Q13336 389 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 SPIDRQ14159 915 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 DPY19L1Q2PZI1 675 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 COQ5Q5HYK3 327 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 MANEAQ5SRI9 462 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 KMT5CQ86Y97 462 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 PGAM4Q8N0Y7 254 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 GTF2H4Q92759 462 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 ZNF285Q96NJ3 590 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 ROGDIQ9GZN7 287 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 ANKHQ9HCJ1 492 aa16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
LTV1-201ENST00000367576 A0A088AWK7 358 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 TXNDC9O14530 226 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 PCSK2P16519 638 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CDKN2CP42773 168 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 HEPACAMQ14CZ8 416 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 MPEG1Q2M385 716 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 RNF148Q8N7C7 305 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 FAM47BQ8NA70 645 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 DNAJB14Q8TBM8 379 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ROPN1LQ96C74 230 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 LRRC58Q96CX6 371 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CSF3RQ99062 836 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 FAIM2Q9BWQ8 316 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 RMND5AQ9H871 391 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SERHLQ9NQF3 203 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 FGF21Q9NSA1 209 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SLC6A13Q9NSD5 602 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 GID8Q9NWU2 228 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ADA2Q9NZK5 511 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 HCN3Q9P1Z3 774 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 MAPRE3Q9UPY8 281 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SLC22A7Q9Y694 548 aa16.83■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CFAP73A6NFT4 308 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 RPL3P39023 403 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 LIM2P55344 173 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CORO7P57737 925 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 NDUFA9Q16795 377 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 TCTE1Q5JU00 501 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 HACD2Q6Y1H2 254 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CAMKMTQ7Z624 323 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 DPP10Q8N608 796 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 OR8J2Q8NGG1 315 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 COQ8BQ96D53 544 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ITCHQ96J02 903 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CDRT15Q96T59 188 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 RBCK1Q9BYM8 510 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 NDE1Q9NXR1 346 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 PDP2Q9P2J9 529 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SCN3AQ9NY46 2000 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 PGRMC2O15173 223 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 KCNH1O95259 989 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD34CP0C6C1 535 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 NR2F6P10588 404 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 TGM1P22735 817 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CPN2P22792 545 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SLC7A2P52569 658 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SHC2P98077 582 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 FOXM1Q08050 763 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 GRM7Q14831 915 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 RABL3Q5HYI8 236 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 DLEU7Q6UYE1 221 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SLITRK4Q8IW52 837 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ULK2Q8IYT8 1036 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 MTERF3Q96E29 417 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ATAD3AQ9NVI7 634 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa16.82■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 UNC13CQ8NB66 2214 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 PROM1O43490 865 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 FOXS1O43638 330 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SCN2BO60939 215 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CBFA2T3O75081 653 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 GUCY1B2O75343 617 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 GSTM5P46439 218 aa16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms