RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 C7P10643 843 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 SLC27A4Q6P1M0 643 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 ANKFN1Q8N957 763 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 PLCZ1Q86YW0 608 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 GOLM1Q8NBJ4 401 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 TUBA1CQ9BQE3 449 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF224Q9NZL3 707 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 FHP07954 510 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 ITIH1P19827 911 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 HSPBAP1Q96EW2 488 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 HAPLN2Q9GZV7 340 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 GNG8Q9UK08 70 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa19.49■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf226A1L170 272 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 EEDO75530 441 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 PRH1P02810 166 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 MOGQ16653 247 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 PTCHD1Q96NR3 888 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 CMKLR1Q99788 373 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 CDH10Q9Y6N8 788 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 K7ERQ8 282 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 FAAHO00519 579 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 EMC8O43402 210 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN9O75954 239 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 OR12D1P0DN82 309 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 CLDN8P56748 225 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 ABRAXAS2Q15018 415 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 CATSPEREQ5SY80 951 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 P4HA3Q7Z4N8 544 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 DPAGT1Q9H3H5 408 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 MEIS3P2A8K0S8 358 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 SPINT3P49223 89 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 DEFB134Q4QY38 66 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 HACD2Q6Y1H2 254 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 GID4Q8IVV7 300 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 OR5M3Q8NGP4 307 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM234Q8WY98 164 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 DPH7Q9BTV6 452 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 G6PC3Q9BUM1 346 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 IL23AQ9NPF7 189 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 RNF186Q9NXI6 227 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 BAIAP2Q9UQB8 552 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PPW3 197 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 M0QZQ0 153 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 AMIGO1Q86WK6 493 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 FIBINQ8TAL6 211 aa19.48■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 GRXCR1A8MXD5 290 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 TTC34A8MYJ7 566 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 ANKDD1AQ495B1 522 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 COQ5Q5HYK3 327 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 PAQR7Q86WK9 346 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 SCRN2Q96FV2 425 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 SLC30A2Q9BRI3 323 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 SLAMF1Q13291 335 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF615Q8N8J6 731 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 OR52B6Q8NGF0 335 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 MUSKO15146 869 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 CSN2P05814 226 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 WNT7BP56706 349 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 CEACAM7Q14002 265 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 C7orf57Q8NEG2 295 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 NUP43Q8NFH3 380 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 PIP5K1AQ99755 562 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 MYADML2A6NDP7 307 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF878C9JN71 531 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 TNFRSF10BO14763 440 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 HPRP00739 348 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 ST3GAL4Q11206 333 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM35AQ53FP2 167 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 EMC10Q5UCC4 262 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0319Q5VV43 1072 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 FANCFQ9NPI8 374 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 LAMP5Q9UJQ1 280 aa19.47■□□□□ 0.71
CCSAP-203ENST00000366687 AXIN1O15169 862 aa19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms