RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 HMG20BQ9P0W2 317 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 IL20RAQ9UHF4 553 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM153AQ9UHL3 310 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 NARFQ9UHQ1 456 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAN1B1Q9UKM7 699 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNPEPQ9ULA0 475 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLA2G4CQ9UP65 541 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 KIF7Q2M1P5 1343 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPHP3Q7Z494 1330 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A087WW49 117 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM149AA5PLN7 773 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPIPB9F8W1W9 429 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNF103O00237 685 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 OGTO15294 1046 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF749O43361 778 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 GRID2O43424 1007 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 LANCL1O43813 399 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZG16O60844 167 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLN5O75503 358 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRT36O76013 467 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 AKR7A3O95154 331 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 EML2O95834 649 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 EPOP01588 193 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGHEP01854 428 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGHG3P01860 377 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 PROS1P07225 676 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRKAR1AP10644 381 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRT5P13647 590 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 AADACP22760 399 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACP1P24666 158 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 FEN1P39748 380 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR3A3P47888 321 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC6A12P48065 614 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCL11P51671 97 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 LIMK2P53671 638 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 GEMP55040 296 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 PEX3P56589 373 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 HERV-K104P61576 105 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 GUCY2DQ02846 1103 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 DRP2Q13474 957 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 GRB14Q14449 540 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 STX1AQ16623 288 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPAT3Q53EU6 434 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 LIPJQ5W064 366 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 DLEU7Q6UYE1 221 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF730Q6ZMV8 503 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CATSPER4Q7RTX7 472 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF329Q86UD4 541 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 PARP8Q8N3A8 854 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM89BQ8N5H3 189 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 NIPA2Q8N8Q9 360 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 AQP11Q8NBQ7 271 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNF149Q8NC42 400 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR6S1Q8NH40 331 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGAP45Q92619 1136 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CASP10Q92851 521 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAB3CQ96E17 227 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 OMA1Q96E52 524 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAGED4Q96JG8 741 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 GUCD1Q96NT3 240 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM111AQ96PZ2 611 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 LITAFQ99732 161 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SSX3Q99909 188 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM213AQ9BRX8 229 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 WDR13Q9H1Z4 485 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 NGBQ9NPG2 151 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 IL1RAPQ9NPH3 570 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 COMMD8Q9NX08 183 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLEK2Q9NYT0 353 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACTR3BQ9P1U1 418 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF319Q9P2F9 582 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP8B3O60423 1300 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRR23AA6NEV1 266 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 C15orf61A6NNL5 157 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC1A7O00341 560 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 TXNL1O43396 289 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMPD2O60906 423 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANXA9O76027 345 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR6B1O95007 311 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANGPTL1O95841 491 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC192P0DO97 292 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 C4BPBP20851 252 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 GLRA1P23415 457 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-487P-201ENST00000365430 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.2 ms