RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 HLA-DMAP28067 261 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SLC6A8P48029 635 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ART1P52961 327 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 DLX5P56178 289 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 BDH1Q02338 343 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 DGCR6Q14129 220 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 FBXL19Q6PCT2 694 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 ELP4Q96EB1 424 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PIP5K1AQ99755 562 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 NRP1O14786 923 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TP73O15350 636 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 UBE2NLQ5JXB2 153 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 IL17RCQ8NAC3 791 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 HAS1Q92839 578 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF566Q969W8 418 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GMLQ99445 158 aa4.74□□□□□ -1.65
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